Protein–RNA interactions for Protein: P60509

ERVPABLB-1, Endogenous retrovirus group PABLB member 1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVPABLB-1P60509 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 PRR29-209ENST00000582540 967 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 AC104971.3-201ENST00000589794 335 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 BRI3BP-201ENST00000341446 6648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 MAP6-202ENST00000434603 4329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 CLEC18A-202ENST00000393701 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 CLEC18C-203ENST00000541793 1955 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 STOX1-204ENST00000399169 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 KIF16B-203ENST00000408042 4640 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 FRMD4A-203ENST00000357447 6821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 FBXO21-201ENST00000330622 2906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 DMKN-209ENST00000429837 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 NKX2-6-201ENST00000325017 906 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 WBP2-203ENST00000433525 928 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 SEC24B-AS1-203ENST00000505895 800 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 LINC01336-202ENST00000506086 479 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 WDR25-203ENST00000542471 1214 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 TAB1-202ENST00000331454 1660 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 LIMS2-208ENST00000410011 2335 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 LINC00472-203ENST00000426635 2958 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 RPN1-201ENST00000296255 2314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 KLF10-201ENST00000285407 3097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 BRIX1-201ENST00000336767 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 LCORL-203ENST00000382226 5009 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 FAM129B-201ENST00000373312 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 NKAIN2-201ENST00000368416 1106 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 AC023141.5-201ENST00000458585 616 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 GRIFIN-202ENST00000614228 461 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 AL359644.1-202ENST00000637541 571 ntTSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 PRDM5-202ENST00000394435 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
ERVPABLB-1P60509 FAM210B-201ENST00000371384 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.2 ms