Protein–RNA interactions for Protein: P60507

ERVFC1, Endogenous retrovirus group FC1 Env polyprotein, humanhuman

Predictions only

Length 584 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ERVFC1P60507 PTPRJ-207ENST00000613246 7851 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 MBOAT1-201ENST00000324607 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 CREG2-201ENST00000324768 6383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 PANX1-201ENST00000227638 2769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 TTC19-201ENST00000261647 3002 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 FBXL3-201ENST00000355619 3503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 ZFAND2B-203ENST00000409206 1159 ntTSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 ZFAND2B-212ENST00000444522 1199 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 AL606760.2-202ENST00000452466 524 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 HSPB7-207ENST00000487046 844 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 FAU-205ENST00000527548 538 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 RAB43P1-201ENST00000561790 589 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 CTBP2P3-201ENST00000585629 1255 ntBASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 GPRC5B-201ENST00000300571 5213 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 TDRKH-203ENST00000368824 2824 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 SLC29A4-202ENST00000396872 5685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 TMEM155-201ENST00000337677 2313 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 GSDMD-206ENST00000526406 2496 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 ANKIB1-201ENST00000265742 6081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 AUTS2-201ENST00000342771 6173 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 POLDIP3-202ENST00000339677 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 THEG-201ENST00000342640 1877 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 DDC-202ENST00000380984 1366 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 SZT2-AS1-201ENST00000396885 699 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 VGLL4-202ENST00000413604 1554 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 ATF7-204ENST00000548118 774 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 MALAT1-211ENST00000617791 394 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 STIM2-212ENST00000639640 2241 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 OBSL1-203ENST00000373876 5503 ntTSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 EDEM1-201ENST00000256497 6146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 C14orf28-201ENST00000325192 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 TIMM50-202ENST00000544017 2572 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.34■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 OLA1-202ENST00000344357 1656 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ERVFC1P60507 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 PRMT1-202ENST00000454376 1327 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 AJUBA-202ENST00000361265 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 FLYWCH2-201ENST00000293981 915 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 MFAP2-201ENST00000375534 970 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 IFITM3-201ENST00000399808 808 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 AL356441.1-201ENST00000452618 492 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 HOXB3-204ENST00000465120 943 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ERVFC1P60507 ASF1B-202ENST00000474890 765 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.2 ms