Protein–RNA interactions for Protein: P58304

VSX2, Visual system homeobox 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 361 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VSX2P58304 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX2P58304 DIXDC1-208ENST00000615255 4825 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX2P58304 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX2P58304 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX2P58304 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX2P58304 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
VSX2P58304 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 SEPHS2-201ENST00000478753 2551 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 MAN2A2-216ENST00000559717 6704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 C2orf54-203ENST00000402775 1958 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 CCNL2-203ENST00000408952 1857 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 BET1L-203ENST00000382762 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 NEK3-206ENST00000611833 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 CRYBA2-201ENST00000295728 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 C8orf46-213ENST00000521495 557 ntTSL 4 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 SNHG9-202ENST00000564014 471 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 HYAL3-201ENST00000336307 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 C9orf62-201ENST00000623103 1924 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 NCAPD2-201ENST00000315579 5548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 JMY-201ENST00000396137 9042 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 PCDHGA12-202ENST00000613314 2634 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 ADRB3-201ENST00000345060 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
VSX2P58304 CDKN1A-204ENST00000448526 2104 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX2P58304 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX2P58304 NOX4-207ENST00000525196 1555 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX2P58304 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX2P58304 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX2P58304 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX2P58304 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX2P58304 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX2P58304 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX2P58304 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX2P58304 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX2P58304 KLHDC7B-201ENST00000395676 2991 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX2P58304 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX2P58304 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX2P58304 DAB2IP-205ENST00000408936 6784 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX2P58304 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX2P58304 AP006288.1-201ENST00000446065 395 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX2P58304 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX2P58304 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX2P58304 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX2P58304 ATP6V0D1-203ENST00000540149 1262 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX2P58304 RARRES2P8-201ENST00000566335 367 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX2P58304 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX2P58304 AP001160.2-201ENST00000596071 487 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX2P58304 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX2P58304 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX2P58304 DHCR7-201ENST00000355527 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX2P58304 ZNRF3-201ENST00000402174 2667 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX2P58304 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX2P58304 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX2P58304 VASN-201ENST00000304735 2806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX2P58304 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX2P58304 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX2P58304 CCDC112-205ENST00000506442 2145 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX2P58304 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
VSX2P58304 SPIDR-227ENST00000541342 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37 ms