Protein–RNA interactions for Protein: P57796

CABP4, Calcium-binding protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CABP4P57796 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CABP4P57796 ARID3A-201ENST00000263620 5941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CABP4P57796 BCR-201ENST00000305877 7082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CABP4P57796 C14orf180-202ENST00000410013 2009 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CABP4P57796 YBEY-202ENST00000339195 890 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CABP4P57796 YBEY-203ENST00000397691 764 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CABP4P57796 AL136311.1-206ENST00000416069 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CABP4P57796 PMF1-BGLAP-203ENST00000490491 1007 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
CABP4P57796 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CABP4P57796 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CABP4P57796 AC126696.2-201ENST00000563687 522 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CABP4P57796 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CABP4P57796 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC21.3■■□□□ 1
CABP4P57796 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CABP4P57796 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CABP4P57796 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CABP4P57796 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CABP4P57796 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC21.3■■□□□ 1
CABP4P57796 IQSEC2-218ENST00000640694 5958 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CABP4P57796 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CABP4P57796 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CABP4P57796 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CABP4P57796 STRN3-202ENST00000357479 2799 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
CABP4P57796 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
CABP4P57796 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CABP4P57796 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CABP4P57796 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CABP4P57796 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CABP4P57796 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CABP4P57796 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CABP4P57796 PLCB2-202ENST00000456256 4242 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CABP4P57796 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CABP4P57796 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CABP4P57796 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CABP4P57796 AZIN1-201ENST00000337198 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CABP4P57796 DDX51-202ENST00000397333 4718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CABP4P57796 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CABP4P57796 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CABP4P57796 CCDC182-201ENST00000299415 832 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
CABP4P57796 LINC00229-201ENST00000443783 500 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CABP4P57796 HHEX-203ENST00000492654 808 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CABP4P57796 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC21.29■■□□□ 1
CABP4P57796 CCDC157-201ENST00000338306 3001 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CABP4P57796 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
CABP4P57796 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CABP4P57796 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CABP4P57796 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CABP4P57796 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CABP4P57796 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CABP4P57796 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
CABP4P57796 MAGI3-201ENST00000307546 6430 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
CABP4P57796 ZNF280B-203ENST00000626650 5721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 SLC12A5-210ENST00000616202 2445 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 AC138969.3-201ENST00000546612 1459 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 AC138932.2-201ENST00000548268 1459 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 AC126755.4-201ENST00000549796 1459 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 SMARCA4-203ENST00000429416 5691 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 CIDEA-201ENST00000320477 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 ACTA1-201ENST00000366683 1122 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 SSR4-204ENST00000370087 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 AGER-204ENST00000375067 1250 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 LRCH3-201ENST00000334859 2258 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 NOP14-204ENST00000502735 2723 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 FAM91A1-201ENST00000334705 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 HFE2-205ENST00000497365 1419 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 SRRM3-204ENST00000611745 3612 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 PCCA-203ENST00000376286 2481 ntTSL 2 BASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
CABP4P57796 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CABP4P57796 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CABP4P57796 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CABP4P57796 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CABP4P57796 RIC8B-203ENST00000392839 2440 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CABP4P57796 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC21.27■■□□□ 1
CABP4P57796 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
CABP4P57796 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CABP4P57796 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
CABP4P57796 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
CABP4P57796 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.6 ms