Protein–RNA interactions for Protein: P57740

NUP107, Nuclear pore complex protein Nup107, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP107P57740 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 ZNF655-218ENST00000454654 571 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 TTLL12-204ENST00000494035 888 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 AC034213.1-201ENST00000507681 806 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 AC010226.1-202ENST00000508517 539 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 AC009533.2-201ENST00000543664 586 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 AC092725.1-201ENST00000565783 499 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 GPALPP1-207ENST00000611650 899 ntBASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 RABGAP1L-201ENST00000251507 2899 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 TGDS-201ENST00000261296 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 MFGE8-201ENST00000268150 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 PLPPR4-203ENST00000457765 4846 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
NUP107P57740 DNAAF5-201ENST00000297440 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 BX276092.7-203ENST00000637198 1536 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 RGL2-247ENST00000497454 3278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 C16orf71-204ENST00000590191 2564 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 C16orf89-202ENST00000472572 1444 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 KRT8P47-201ENST00000604727 1398 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 GSK3B-201ENST00000264235 7711 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 LTV1-201ENST00000367576 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 CCDC74A-202ENST00000409856 1298 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 MEG3-211ENST00000452514 461 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 PACRGL-218ENST00000507634 1142 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 C19orf25-210ENST00000591027 574 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 BABAM1-206ENST00000595632 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 FAM25C-201ENST00000617224 319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 SLC35G6-201ENST00000412468 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 PBK-201ENST00000301905 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 TEAD2-204ENST00000593945 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 CCDC115-201ENST00000259229 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 PCDHA10-201ENST00000307360 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 IRF7-207ENST00000525445 1588 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
NUP107P57740 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 TNXB-208ENST00000611016 6083 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 MSL1-206ENST00000579565 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 CXorf58-201ENST00000379211 1752 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 PTCHD3-202ENST00000622555 1720 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 TSPAN32-201ENST00000182290 1318 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 TSPAN32-217ENST00000612299 1301 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 MAGI3-204ENST00000369617 3911 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 PDLIM7-202ENST00000355841 1689 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 RUSC1-205ENST00000368354 3114 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 NUDT6-201ENST00000304430 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 MMP24-AS1-209ENST00000456790 712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 AC099811.2-203ENST00000592574 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 LIN28B-AS1-205ENST00000637414 879 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 FGF11-201ENST00000293829 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
NUP107P57740 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.2 ms