Protein–RNA interactions for Protein: P56975

NRG3, Pro-neuregulin-3, membrane-bound isoform, humanhuman

Predictions only

Length 720 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NRG3P56975 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG3P56975 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG3P56975 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG3P56975 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG3P56975 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG3P56975 AL590999.1-203ENST00000606829 542 ntTSL 4 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG3P56975 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG3P56975 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG3P56975 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG3P56975 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG3P56975 GLG1-202ENST00000422840 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG3P56975 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG3P56975 FLJ38576-201ENST00000623820 2459 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG3P56975 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG3P56975 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG3P56975 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG3P56975 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
NRG3P56975 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 CFAP45-201ENST00000368099 1842 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 JRK-209ENST00000612905 9124 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 ELF2-204ENST00000394235 4012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 MIB2-202ENST00000378708 3012 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 CALM1-205ENST00000553542 877 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 PDPK2P-202ENST00000562415 1191 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 ELOF1-204ENST00000587806 1172 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 AL671883.3-201ENST00000603274 991 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 C1QL3-202ENST00000619991 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 EIF4G1-204ENST00000352767 5484 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 BLOC1S5-202ENST00000397457 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 MREG-205ENST00000620139 2618 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 ARL4C-202ENST00000390645 4013 ntAPPRIS P1 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 CNTNAP3B-201ENST00000276974 3240 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 IL34-202ENST00000429149 1779 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 SLIT1-204ENST00000371070 4564 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 SSR4-201ENST00000320857 1671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 SEPT6-209ENST00000489216 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
NRG3P56975 GRAMD1A-211ENST00000599564 2825 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 LGMN-202ENST00000393218 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 NTRK1-202ENST00000368196 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 ZBTB22-207ENST00000418724 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 PGRMC2-207ENST00000520121 3785 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 TTC13-202ENST00000366662 3112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 NR6A1-205ENST00000487099 7031 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 LAT2-201ENST00000275635 1869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 C22orf39-203ENST00000399568 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 IMP4-203ENST00000409935 958 ntTSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
NRG3P56975 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.5 ms