Protein–RNA interactions for Protein: P55211

CASP9, Caspase-9, humanhuman

Predictions only

Length 416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASP9P55211 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 NFATC4-203ENST00000422617 5491 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 ISCU-205ENST00000535729 1330 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 MRPL28-203ENST00000429738 310 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 TSTD3-201ENST00000452647 962 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 AC021087.4-201ENST00000563761 564 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 CCDC106-206ENST00000591241 1153 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 AC025062.2-201ENST00000605477 670 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 ATXN7-213ENST00000538065 6842 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 KEAP1-201ENST00000171111 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 SPAG1-202ENST00000388798 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
CASP9P55211 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 KCNC2-209ENST00000550433 2931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 MBL1P-201ENST00000480805 1424 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 PSD-201ENST00000020673 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 RGS11-203ENST00000359740 1371 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 SYT15-201ENST00000374321 1369 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 SLC25A45-202ENST00000398802 2286 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 GFAP-203ENST00000435360 1779 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 PVR-204ENST00000406449 1344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 ICMT-201ENST00000343813 4771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 ADORA1-204ENST00000367236 3407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 INSL3-201ENST00000317306 755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 PRSS50-201ENST00000460241 2960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 ZFPM1-204ENST00000563351 808 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 CYGB-205ENST00000590175 830 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 SNRK-204ENST00000454177 2961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CASP9P55211 C6orf136-203ENST00000376473 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP9P55211 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP9P55211 TSPY26P-202ENST00000565928 3884 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP9P55211 RGPD8-201ENST00000302558 5576 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP9P55211 MCM4-201ENST00000262105 4183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP9P55211 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP9P55211 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP9P55211 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP9P55211 TMEM263-201ENST00000280756 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP9P55211 IQSEC3-203ENST00000538872 7094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP9P55211 CARS-203ENST00000397111 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP9P55211 FGD4-212ENST00000534526 2977 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP9P55211 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP9P55211 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP9P55211 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP9P55211 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CASP9P55211 AL355310.2-201ENST00000369843 688 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms