Protein–RNA interactions for Protein: P54764

EPHA4, Ephrin type-A receptor 4, humanhuman

Predictions only

Length 986 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EPHA4P54764 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 OR2C3-203ENST00000617752 2481 ntAPPRIS P1 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 C6orf52-202ENST00000379586 430 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 TNNT3-204ENST00000381558 1258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 CDH23-AS1-201ENST00000428918 378 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 SERPINA7P1-201ENST00000443077 631 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 DUX4L27-201ENST00000554796 1261 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 ASAH1-231ENST00000636577 2129 ntTSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 NAPA-AS1-201ENST00000593284 1753 ntTSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 MCM9-201ENST00000316068 2442 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 MDFIC-201ENST00000257724 4598 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 BLCAP-201ENST00000373537 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 COQ8A-201ENST00000366777 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 PLEKHM2-201ENST00000375793 4004 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 HCRTR1-203ENST00000403528 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 SCLT1-204ENST00000503215 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 THAP8-201ENST00000292894 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 FGFR4-203ENST00000393648 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 FAM178B-204ENST00000490605 2710 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 AL645608.8-201ENST00000606034 2086 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 RNF128-201ENST00000255499 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 AES-201ENST00000221561 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 PIP5KL1-201ENST00000300432 1104 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 RPL21-203ENST00000319826 806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 KCNJ5-201ENST00000338350 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 MUTYH-201ENST00000354383 1744 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 FBLIM1-202ENST00000375766 3695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 AMACR-202ENST00000382068 862 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 AC055876.3-201ENST00000431496 288 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 USH1C-205ENST00000527020 2159 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 AQP6-203ENST00000551733 849 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 GMPR2-217ENST00000559104 1719 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 RARRES2P9-201ENST00000565168 469 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 GABARAPL1-201ENST00000266458 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 EIF5A-206ENST00000571955 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 TRIM11-202ENST00000366699 2511 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 SLC29A2-206ENST00000546034 2509 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 SPRYD7-201ENST00000361840 3053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 WBP2-201ENST00000254806 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC15.98■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 BPIFB4-201ENST00000375483 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 MYC-202ENST00000377970 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
EPHA4P54764 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.8 ms