Protein–RNA interactions for Protein: P50402

EMD, Emerin, humanhuman

Predictions only

Length 254 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EMDP50402 SLC45A1-202ENST00000471889 2784 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMDP50402 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMDP50402 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMDP50402 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMDP50402 ZNF804A-201ENST00000302277 4690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMDP50402 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMDP50402 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMDP50402 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMDP50402 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMDP50402 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMDP50402 AC004832.2-201ENST00000426397 482 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
EMDP50402 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMDP50402 AC009567.1-201ENST00000515071 525 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMDP50402 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMDP50402 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMDP50402 KIRREL3-AS1-201ENST00000548204 586 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMDP50402 DYNLL1-204ENST00000548214 616 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMDP50402 COQ7-208ENST00000568985 714 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMDP50402 FLYWCH2-203ENST00000572006 754 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMDP50402 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMDP50402 UBE3D-208ENST00000626828 114 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMDP50402 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMDP50402 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMDP50402 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMDP50402 LHCGR-204ENST00000405626 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMDP50402 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMDP50402 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMDP50402 PTK7-202ENST00000230419 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMDP50402 FCGBP-203ENST00000620799 4926 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMDP50402 PTPRA-205ENST00000399903 3337 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMDP50402 STXBP1-216ENST00000636962 2918 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMDP50402 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMDP50402 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMDP50402 TRIM9-201ENST00000298355 5284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMDP50402 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMDP50402 MAP4K3-201ENST00000263881 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
EMDP50402 KCTD20-202ENST00000373731 5619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 HSD17B12-201ENST00000278353 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 DPY19L3-206ENST00000587077 2456 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 STIM2-203ENST00000467011 3925 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 WASF1-206ENST00000392588 3122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 EEFSEC-202ENST00000483457 1859 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 MAP4K3-202ENST00000341681 4271 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 SLC43A3-203ENST00000395124 2617 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 ZPBP2-204ENST00000584588 1277 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 CROCCP3-203ENST00000589964 255 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 METTL23-215ENST00000615984 1171 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 RANBP9-201ENST00000011619 3113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 PCGF3-213ENST00000620529 1899 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 B3GNT3-202ENST00000595387 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
EMDP50402 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EMDP50402 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMDP50402 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMDP50402 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMDP50402 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMDP50402 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMDP50402 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMDP50402 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMDP50402 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMDP50402 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMDP50402 PAXX-201ENST00000371620 812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMDP50402 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
EMDP50402 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMDP50402 CBX7-202ENST00000401405 784 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMDP50402 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMDP50402 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMDP50402 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMDP50402 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
EMDP50402 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.6 ms