Protein–RNA interactions for Protein: P49768

PSEN1, Presenilin-1, humanhuman

Predictions only

Length 467 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSEN1P49768 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 CYP51A1P2-201ENST00000419457 1499 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 CACNA2D2-201ENST00000266039 5476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 SYTL3-205ENST00000611299 2896 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 THAP3-202ENST00000307896 1046 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 C2orf76-201ENST00000334816 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 PRR29-203ENST00000425164 1266 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 NPM1P28-201ENST00000492269 840 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 EEF1D-223ENST00000528610 923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 KRT19P2-202ENST00000557173 1012 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 LINC01128-210ENST00000609139 455 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 SLC8A1-AS1-218ENST00000610721 956 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 TEX264-216ENST00000614067 1174 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 ELF2-201ENST00000358635 3036 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 CTNNBIP1-203ENST00000377263 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
PSEN1P49768 PTHLH-205ENST00000535992 1891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 SLC22A23-210ENST00000490273 2043 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 FZD1-201ENST00000287934 6963 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 VSIG10L2-202ENST00000638636 2304 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 AC133548.2-201ENST00000568567 2605 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 RPAIN-203ENST00000381209 1535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC17.77■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 CFAP77-201ENST00000343036 1818 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 PRSS16-201ENST00000230582 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 PKN1-202ENST00000342216 2960 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 NRP1-204ENST00000374822 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 SARS2-201ENST00000221431 2057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 OR8K1-201ENST00000279783 1087 ntAPPRIS P1 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 PAQR6-204ENST00000356983 2143 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 LINC01786-201ENST00000434139 268 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 AL049829.1-201ENST00000465411 156 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 HOXC-AS3-202ENST00000513165 533 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 AC027701.1-202ENST00000520988 459 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 AC090709.1-201ENST00000548384 716 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 MIR3687-2-201ENST00000577708 61 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 AC135178.5-201ENST00000602597 674 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 MIR3687-1-201ENST00000614492 61 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 HOTTIP_1.1-201ENST00000620415 57 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 AL645728.2-201ENST00000641974 660 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 AXL-202ENST00000359092 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 ARHGAP26-201ENST00000274498 6862 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 SYVN1-201ENST00000294256 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 RHBDF1P1-201ENST00000427504 1941 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 TAF1C-222ENST00000570117 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 DLC1-203ENST00000358919 4392 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 GRK5-202ENST00000392870 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 BANP-227ENST00000626016 2144 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 IL6R-202ENST00000368485 5914 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 RNF217-211ENST00000560949 5145 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 HEBP2-204ENST00000607197 10014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 UPF3AP3-201ENST00000420996 769 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 AL590723.1-201ENST00000426030 629 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 OLA1-206ENST00000428402 1270 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 AL513480.1-201ENST00000451731 511 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 AC117500.1-201ENST00000497352 755 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 LINC02123-201ENST00000514869 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 AC022087.1-201ENST00000558372 612 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 AL353708.1-201ENST00000567904 1257 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 AC008147.4-201ENST00000617570 1204 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
PSEN1P49768 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.5 ms