Protein–RNA interactions for Protein: P49759

CLK1, Dual specificity protein kinase CLK1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLK1P49759 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLK1P49759 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLK1P49759 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLK1P49759 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLK1P49759 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLK1P49759 WDR90-202ENST00000315764 1454 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLK1P49759 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLK1P49759 DPH6-AS1-201ENST00000501169 1477 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLK1P49759 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLK1P49759 TCP11L2-203ENST00000547153 1788 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLK1P49759 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLK1P49759 TLE1-202ENST00000376484 666 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLK1P49759 AL020989.1-201ENST00000422979 469 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLK1P49759 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLK1P49759 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLK1P49759 AC073592.4-201ENST00000623827 446 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLK1P49759 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLK1P49759 CABP4-202ENST00000438189 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLK1P49759 CCAR2-201ENST00000308511 4853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLK1P49759 PDE9A-203ENST00000335440 1728 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLK1P49759 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLK1P49759 NDUFA11-205ENST00000592634 2154 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLK1P49759 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLK1P49759 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLK1P49759 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLK1P49759 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLK1P49759 SUSD4-208ENST00000494793 1833 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLK1P49759 AC046185.3-201ENST00000623228 1824 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLK1P49759 AC078925.2-201ENST00000624013 1973 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
CLK1P49759 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLK1P49759 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLK1P49759 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
CLK1P49759 EGLN2-207ENST00000593726 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLK1P49759 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLK1P49759 CXXC1-212ENST00000589940 2242 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLK1P49759 EPHX2-201ENST00000380476 2064 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLK1P49759 CHGA-202ENST00000334654 1474 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLK1P49759 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLK1P49759 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLK1P49759 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLK1P49759 CDS2-203ENST00000460006 9298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLK1P49759 NAT9-210ENST00000580301 1860 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLK1P49759 MICAL3-206ENST00000441493 9445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLK1P49759 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLK1P49759 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLK1P49759 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLK1P49759 MED16-201ENST00000269814 1199 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLK1P49759 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLK1P49759 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLK1P49759 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLK1P49759 SIGLEC30P-201ENST00000455569 941 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
CLK1P49759 FGF11-204ENST00000575235 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLK1P49759 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLK1P49759 SPINK2-205ENST00000616980 677 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLK1P49759 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLK1P49759 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLK1P49759 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLK1P49759 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLK1P49759 ZNF7-207ENST00000528372 2905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLK1P49759 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLK1P49759 P2RY6-204ENST00000393592 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLK1P49759 CLDN15-208ENST00000611078 1509 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLK1P49759 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLK1P49759 YDJC-201ENST00000292778 1351 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLK1P49759 ELOA-204ENST00000613537 4924 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLK1P49759 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLK1P49759 C9orf43-202ENST00000374165 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLK1P49759 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
CLK1P49759 MMP15-201ENST00000219271 4250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLK1P49759 YIPF2-204ENST00000586748 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLK1P49759 TAF1D-203ENST00000448108 2082 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLK1P49759 DDB1-201ENST00000301764 4506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLK1P49759 NODAL-201ENST00000287139 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLK1P49759 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLK1P49759 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLK1P49759 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLK1P49759 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLK1P49759 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLK1P49759 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLK1P49759 PTPMT1-201ENST00000326656 928 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLK1P49759 IGLL1-202ENST00000330377 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLK1P49759 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLK1P49759 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLK1P49759 SPDYE21P-201ENST00000413323 827 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CLK1P49759 AL022314.1-201ENST00000414203 464 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLK1P49759 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLK1P49759 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC15.71■□□□□ 0.11
CLK1P49759 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLK1P49759 AL611929.1-201ENST00000457340 449 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLK1P49759 TMEM220-AS1-202ENST00000580899 561 ntTSL 4 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLK1P49759 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLK1P49759 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLK1P49759 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLK1P49759 FAM8A1-201ENST00000259963 4677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLK1P49759 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLK1P49759 EML1-201ENST00000262233 4535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLK1P49759 TCF25-202ENST00000263347 2377 ntTSL 5 BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLK1P49759 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLK1P49759 AC125494.1-203ENST00000396799 1622 ntTSL 1 (best) BASIC15.71■□□□□ 0.11
CLK1P49759 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC15.71■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.8 ms