Protein–RNA interactions for Protein: P49356

FNTB, Protein farnesyltransferase subunit beta, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FNTBP49356 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 NRBP1-204ENST00000379863 2174 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AP005329.2-201ENST00000580139 1771 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTBP49356 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTBP49356 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTBP49356 SOCS2-AS1-202ENST00000500986 1655 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTBP49356 OLFM2-203ENST00000590841 1665 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTBP49356 BAZ1B-201ENST00000339594 6102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTBP49356 HPS3-202ENST00000460120 2745 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTBP49356 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTBP49356 ASB13-201ENST00000357700 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTBP49356 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTBP49356 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTBP49356 HSF2-201ENST00000368455 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTBP49356 ITSN2-201ENST00000355123 6300 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTBP49356 CD276-203ENST00000537340 2439 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTBP49356 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTBP49356 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTBP49356 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTBP49356 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTBP49356 SPAG11A-201ENST00000326558 612 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTBP49356 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTBP49356 PXMP4-202ENST00000344022 989 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTBP49356 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTBP49356 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTBP49356 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTBP49356 LCN10-203ENST00000474369 564 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTBP49356 CD81-207ENST00000481687 890 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTBP49356 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTBP49356 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTBP49356 SLC9A3-AS1-206ENST00000607005 435 ntTSL 3 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTBP49356 PPP1R18-201ENST00000274853 4599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTBP49356 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTBP49356 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTBP49356 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTBP49356 LMNA-208ENST00000448611 1943 ntTSL 2 BASIC16.56■□□□□ 0.24
FNTBP49356 NPBWR1-201ENST00000331251 2687 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 PRRT3-202ENST00000411976 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 PRSS35-201ENST00000369700 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 MAPT-215ENST00000574436 1326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 TADA3-201ENST00000301964 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 CMPK2-201ENST00000256722 2884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AL513303.2-201ENST00000413339 536 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 RASL12-203ENST00000434605 982 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 KRBOX4-207ENST00000487081 1247 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AC093004.1-201ENST00000508850 424 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 SCN4B-204ENST00000529878 566 ntTSL 4 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 OBP2A-206ENST00000539850 914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 PFN2-201ENST00000239940 2261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 KIAA1522-202ENST00000373480 5294 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 KIAA1522-203ENST00000373481 5293 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 KRT5-201ENST00000252242 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 APP-202ENST00000348990 3355 ntTSL 1 (best) BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 WDR25-202ENST00000402312 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.55■□□□□ 0.24
FNTBP49356 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTBP49356 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTBP49356 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTBP49356 PLD3-206ENST00000409587 2180 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTBP49356 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTBP49356 FAM234A-203ENST00000399932 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTBP49356 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTBP49356 PPAN-P2RY11-201ENST00000393796 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTBP49356 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTBP49356 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTBP49356 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTBP49356 LINC00116-202ENST00000426713 461 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTBP49356 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTBP49356 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTBP49356 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.54■□□□□ 0.24
FNTBP49356 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.54■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms