Protein–RNA interactions for Protein: P48507

GCLM, Glutamate--cysteine ligase regulatory subunit, humanhuman

Predictions only

Length 274 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GCLMP48507 KIF25-202ENST00000354419 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
GCLMP48507 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLMP48507 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLMP48507 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLMP48507 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLMP48507 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLMP48507 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLMP48507 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLMP48507 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLMP48507 CD99L2-202ENST00000355149 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLMP48507 MIR574-201ENST00000385209 96 ntBASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLMP48507 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLMP48507 IL32-212ENST00000526464 1198 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLMP48507 IL32-217ENST00000530538 674 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLMP48507 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLMP48507 RPS15A-205ENST00000565420 802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLMP48507 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLMP48507 MED16-214ENST00000617672 554 ntTSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLMP48507 AC091980.2-201ENST00000619056 2775 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLMP48507 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLMP48507 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLMP48507 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLMP48507 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
GCLMP48507 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCLMP48507 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCLMP48507 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCLMP48507 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCLMP48507 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCLMP48507 ERO1A-201ENST00000395686 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCLMP48507 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCLMP48507 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC18.02■□□□□ 0.47
GCLMP48507 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
GCLMP48507 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLMP48507 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLMP48507 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLMP48507 KDM6B-202ENST00000448097 5422 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLMP48507 NIPA2-201ENST00000337451 3233 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLMP48507 HCLS1-202ENST00000428394 1560 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLMP48507 PDAP1-201ENST00000350498 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLMP48507 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLMP48507 TBRG4-203ENST00000395655 2225 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLMP48507 KLHL7-201ENST00000322275 969 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLMP48507 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLMP48507 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLMP48507 ASTL-201ENST00000342380 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLMP48507 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLMP48507 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLMP48507 KCNIP2-208ENST00000370046 923 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLMP48507 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLMP48507 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLMP48507 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLMP48507 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLMP48507 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLMP48507 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLMP48507 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLMP48507 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLMP48507 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLMP48507 HPSE-207ENST00000513463 1458 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLMP48507 SPSB2-203ENST00000519357 1496 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLMP48507 GPAT3-208ENST00000611707 2633 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLMP48507 ARCN1-203ENST00000392859 1709 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
GCLMP48507 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 MAGEA2-201ENST00000595583 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 CENPT-208ENST00000562787 2345 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 NFATC4-222ENST00000555590 2830 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 AC005329.1-201ENST00000501448 3571 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 KAZN-201ENST00000361144 3838 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 LETM2-201ENST00000297720 1693 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 WDR45-234ENST00000634838 1545 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 FGFBP2-201ENST00000259989 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 C10orf10-201ENST00000298295 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 LCE1B-201ENST00000360090 1139 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 HIST1H2BL-201ENST00000377401 488 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 AC023274.1-201ENST00000418278 595 ntBASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 AL121672.1-201ENST00000439423 1181 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 SMN2-210ENST00000511812 867 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 AC008403.2-204ENST00000600650 1006 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
GCLMP48507 BACE1-201ENST00000313005 6326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 58.6 ms