Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 CDK18-217ENST00000506784 2143 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRXP46100 SLC2A8-202ENST00000373360 1937 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRXP46100 PLTP-202ENST00000372420 1530 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRXP46100 UBE2R2-201ENST00000263228 4075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRXP46100 LINC00593-202ENST00000560853 1483 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRXP46100 ZUFSP-201ENST00000368573 1225 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRXP46100 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRXP46100 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRXP46100 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRXP46100 CEP57L1-208ENST00000519095 908 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRXP46100 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATRXP46100 AL139327.4-201ENST00000612362 153 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATRXP46100 WT1-AS_2.1-201ENST00000613208 137 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATRXP46100 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRXP46100 KDM4F-201ENST00000545950 1917 ntAPPRIS P1 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRXP46100 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ATRXP46100 HOMEZ-201ENST00000357460 4971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRXP46100 ADAP2-201ENST00000330889 2934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ATRXP46100 LINC00304-203ENST00000565008 1864 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ATRXP46100 TMSB4Y-201ENST00000284856 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRXP46100 LRRC27-203ENST00000368613 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRXP46100 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRXP46100 CARMIL2-201ENST00000334583 4687 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRXP46100 LRPPRC-203ENST00000409946 1848 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRXP46100 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRXP46100 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRXP46100 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRXP46100 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRXP46100 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRXP46100 MPZL3-203ENST00000525386 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRXP46100 AP001005.4-201ENST00000572530 387 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRXP46100 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRXP46100 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRXP46100 GCGR-202ENST00000570996 1872 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRXP46100 RECK-201ENST00000377966 4888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRXP46100 MAPRE1-201ENST00000375571 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRXP46100 DTNB-209ENST00000407038 2294 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRXP46100 GXYLT1-202ENST00000398675 7497 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRXP46100 SSC5D-201ENST00000389623 4845 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRXP46100 AEBP2-201ENST00000266508 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRXP46100 GAREM2-202ENST00000407684 5138 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRXP46100 CD248-201ENST00000311330 2558 ntAPPRIS P1 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRXP46100 ATRIP-201ENST00000320211 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRXP46100 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRXP46100 NFATC1-206ENST00000542384 2142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRXP46100 IDS-203ENST00000428056 1213 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRXP46100 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRXP46100 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRXP46100 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ATRXP46100 AL031600.1-201ENST00000563610 570 ntTSL 4 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRXP46100 CDK17-203ENST00000543119 2442 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRXP46100 ISOC1-201ENST00000173527 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRXP46100 CPQ-201ENST00000220763 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRXP46100 AHRR-209ENST00000512529 1912 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ATRXP46100 PPOX-202ENST00000367999 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ATRXP46100 ZCWPW1-201ENST00000360951 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATRXP46100 CDK13-207ENST00000613626 3099 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATRXP46100 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.02■□□□□ -0
ATRXP46100 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATRXP46100 PRKAR1B-204ENST00000406797 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATRXP46100 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATRXP46100 PITX2-201ENST00000306732 2320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATRXP46100 PGR-201ENST00000263463 2496 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATRXP46100 OPN3-201ENST00000366554 2620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATRXP46100 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATRXP46100 JMJD4-202ENST00000438896 2502 ntTSL 2 BASIC15.02■□□□□ -0
ATRXP46100 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.02■□□□□ -0
ATRXP46100 AC069218.1-201ENST00000435269 762 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATRXP46100 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATRXP46100 AL355310.3-201ENST00000526411 582 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATRXP46100 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC15.02■□□□□ -0
ATRXP46100 AC141586.1-203ENST00000567242 366 ntBASIC15.02■□□□□ -0
ATRXP46100 FOXP4-202ENST00000373057 3300 ntTSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATRXP46100 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02■□□□□ -0
ATRXP46100 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRXP46100 BPGM-202ENST00000393132 2051 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRXP46100 LYSMD4-203ENST00000378904 2122 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRXP46100 AC005622.1-202ENST00000637093 1543 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRXP46100 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRXP46100 GCH1-207ENST00000622544 2923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRXP46100 LGI3-201ENST00000306317 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRXP46100 NEU2-201ENST00000233840 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRXP46100 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRXP46100 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRXP46100 VPS29-201ENST00000360579 1091 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRXP46100 CNR1-201ENST00000362094 1252 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRXP46100 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRXP46100 ENDOV-229ENST00000523999 864 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRXP46100 RRP7BP-205ENST00000566851 833 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRXP46100 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRXP46100 AC010503.4-201ENST00000615487 688 ntBASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRXP46100 NOP16-209ENST00000618911 1087 ntTSL 1 (best) BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRXP46100 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRXP46100 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRXP46100 ANKRD16-203ENST00000380094 2738 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRXP46100 ARRB2-204ENST00000412477 1779 ntTSL 2 BASIC15.02□□□□□ -0.01
ATRXP46100 GALNT9-202ENST00000397325 1727 ntTSL 1 (best) BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRXP46100 SELENBP1-204ENST00000426705 1928 ntTSL 2 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRXP46100 AC020922.1-201ENST00000591954 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.01□□□□□ -0.01
ATRXP46100 GLYCTK-203ENST00000461183 889 ntTSL 3 BASIC15.01□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.2 ms