Protein–RNA interactions for Protein: P43357

MAGEA3, Melanoma-associated antigen 3, humanhuman

Predictions only

Length 314 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAGEA3P43357 MGLL-204ENST00000434178 4941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 NUDT16P1-202ENST00000499077 2208 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 C2orf27A-205ENST00000624391 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 BECN1-213ENST00000590099 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 AC141586.1-201ENST00000399702 2748 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 MC1R-204ENST00000639847 2567 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 IFT27-201ENST00000340630 1113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 DPM2-202ENST00000373110 738 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 PRSS29P-201ENST00000440800 595 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 IMMP2L-207ENST00000452895 833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 AL691432.3-201ENST00000621860 400 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 CLEC18A-209ENST00000615430 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 CLEC18C-211ENST00000618957 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 CLEC18B-205ENST00000619275 2215 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 PLPPR2-201ENST00000251473 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 TEAD4-202ENST00000359864 1690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 TCP10-201ENST00000366827 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
MAGEA3P43357 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 PAUPAR-201ENST00000630360 2965 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 ARFIP2-203ENST00000423813 1430 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 MLXIP-201ENST00000319080 8427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 SUCLA2-201ENST00000378654 2192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 PIH1D1-201ENST00000262265 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 SMIM29-201ENST00000335352 1160 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 MED22-202ENST00000371999 987 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 ELOB-202ENST00000409477 997 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 TSPAN32-207ENST00000451520 1236 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 AF186996.4-201ENST00000467186 377 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 OAZ1-202ENST00000582888 969 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 CNOT6-202ENST00000393356 6303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 BRPF1-201ENST00000383829 4736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 FBF1-205ENST00000586717 4825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 EDA-203ENST00000374552 5278 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 VKORC1L1-201ENST00000360768 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 FOXO3-202ENST00000406360 7341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 STK25-201ENST00000316586 4619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 SERTM1-201ENST00000315190 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 EXT2-210ENST00000533608 3136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 CDK11B-208ENST00000629289 2490 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 MYOD1-201ENST00000250003 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 SLX1A-202ENST00000345535 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 FGF8-203ENST00000346714 694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
MAGEA3P43357 SLX1B-202ENST00000351581 762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.7 ms