Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 KHNYN-202ENST00000553935 3359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPARGP37231 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPARGP37231 CD5L-201ENST00000368174 2191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPARGP37231 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPARGP37231 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPARGP37231 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
PPARGP37231 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 CD72-204ENST00000396757 2035 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 ILDR1-203ENST00000393631 1456 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 BMI1-201ENST00000376663 3428 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 MAP2K7-202ENST00000397981 3430 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 ZNF707-223ENST00000532205 2865 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 DARS-201ENST00000264161 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 PLK2-215ENST00000617412 2792 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 BANP-204ENST00000393208 2283 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 ZNF134-201ENST00000396161 4914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 SARDH-202ENST00000371867 1326 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 DAPK2-202ENST00000457488 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 PPIB-201ENST00000300026 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 EXOSC3-202ENST00000396521 768 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 CD99L2-206ENST00000466436 988 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 AL356056.2-201ENST00000506914 669 ntTSL 4 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 TRMT112-202ENST00000535126 704 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 ATP5G2-204ENST00000549164 745 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 AC116612.1-201ENST00000557144 562 ntTSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 MAP1LC3B-207ENST00000565788 625 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 AP001005.1-201ENST00000571755 1248 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 ATP5G2-209ENST00000602871 668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 GPX4-212ENST00000616066 924 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 LINC01666-201ENST00000623794 845 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 BSG-202ENST00000346916 1605 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 AGK-211ENST00000629555 2765 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 LZTS1-201ENST00000265801 5459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 EDN3-205ENST00000395654 2318 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 PKN3-201ENST00000291906 3375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 ABR-203ENST00000536794 2213 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 AC083864.1-201ENST00000381493 1497 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
PPARGP37231 SLC35E2B-204ENST00000614300 2156 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGP37231 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGP37231 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGP37231 AC226118.1-201ENST00000515213 2146 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGP37231 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGP37231 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGP37231 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGP37231 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGP37231 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGP37231 SHISA9-203ENST00000558583 6724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGP37231 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGP37231 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGP37231 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGP37231 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGP37231 FRS2-206ENST00000549921 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGP37231 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGP37231 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGP37231 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGP37231 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGP37231 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGP37231 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGP37231 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGP37231 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGP37231 DLG4-201ENST00000302955 3184 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGP37231 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGP37231 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGP37231 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGP37231 WASF1-207ENST00000392589 3220 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGP37231 ZNF628-201ENST00000391718 3177 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGP37231 SEPT8-208ENST00000378721 1723 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGP37231 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
PPARGP37231 GALNT6-201ENST00000356317 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41 ms