Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 TTC24-202ENST00000368237 1969 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 CR392000.2-201ENST00000640235 1994 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 AC090340.1-201ENST00000620778 4980 ntBASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 FNBP1-202ENST00000420781 5410 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 SEC14L2-215ENST00000617837 2632 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 SLC39A7-202ENST00000374677 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 DUSP26-203ENST00000523956 1373 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 KCTD15-202ENST00000430256 2555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 DAG1-222ENST00000545947 5829 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.76■□□□□ 0.27
GJA4P35212 PGAP3-203ENST00000378011 2533 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJA4P35212 FENDRR-206ENST00000599749 2843 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJA4P35212 ADCY8-201ENST00000286355 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJA4P35212 KIAA1522-204ENST00000401073 5438 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJA4P35212 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GJA4P35212 SPOPL-201ENST00000280098 6025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJA4P35212 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJA4P35212 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJA4P35212 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJA4P35212 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJA4P35212 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJA4P35212 MAP9-202ENST00000379248 1165 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJA4P35212 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GJA4P35212 AKIP1-211ENST00000534506 576 ntTSL 3 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJA4P35212 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJA4P35212 SLC8B1-206ENST00000549069 1058 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJA4P35212 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJA4P35212 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJA4P35212 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJA4P35212 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJA4P35212 LGI4-201ENST00000310123 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJA4P35212 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJA4P35212 TEKT2-201ENST00000207457 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJA4P35212 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJA4P35212 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC16.75■□□□□ 0.27
GJA4P35212 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.75■□□□□ 0.27
GJA4P35212 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA4P35212 TMC6-202ENST00000322914 2786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA4P35212 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA4P35212 FAM49B-224ENST00000522941 1700 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA4P35212 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA4P35212 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA4P35212 TRAF3IP1-201ENST00000373327 4279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA4P35212 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA4P35212 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA4P35212 TOMM5-201ENST00000321301 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA4P35212 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA4P35212 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA4P35212 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA4P35212 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA4P35212 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA4P35212 PPP1R14A-203ENST00000587515 607 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA4P35212 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA4P35212 CD8A-202ENST00000352580 1977 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA4P35212 CCT6A-202ENST00000335503 2529 ntTSL 5 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA4P35212 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA4P35212 GPAA1P2-202ENST00000606848 1787 ntBASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA4P35212 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA4P35212 C6orf223-203ENST00000442114 3109 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA4P35212 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA4P35212 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA4P35212 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.74■□□□□ 0.27
GJA4P35212 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA4P35212 PABPC1L-201ENST00000217073 1851 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA4P35212 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA4P35212 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA4P35212 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA4P35212 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA4P35212 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA4P35212 CU639417.3-201ENST00000624240 1404 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA4P35212 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA4P35212 NUAK1-201ENST00000261402 6828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA4P35212 FIBP-201ENST00000338369 1261 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA4P35212 RTN4RL2-202ENST00000395120 582 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA4P35212 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA4P35212 MEIS3P1-201ENST00000495167 958 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA4P35212 AC008378.1-201ENST00000521251 496 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA4P35212 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA4P35212 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA4P35212 AC010336.2-201ENST00000564226 506 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA4P35212 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA4P35212 AC138474.1-201ENST00000586630 523 ntTSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA4P35212 AP005482.2-201ENST00000587889 310 ntTSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA4P35212 IFI27-210ENST00000616764 716 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA4P35212 IFI27-213ENST00000620066 719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA4P35212 EIF6-209ENST00000621148 1054 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA4P35212 HNF1A-212ENST00000544413 2014 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA4P35212 ERBB2-205ENST00000578199 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA4P35212 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA4P35212 ARHGEF28-203ENST00000426542 6118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA4P35212 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA4P35212 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.73■□□□□ 0.27
GJA4P35212 BOD1L2-201ENST00000585477 3239 ntAPPRIS P1 BASIC16.73■□□□□ 0.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms