Protein–RNA interactions for Protein: P31415

CASQ1, Calsequestrin-1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CASQ1P31415 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 TMEM145-201ENST00000301204 1768 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 ME2-201ENST00000321341 9415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 HOXA3-202ENST00000396352 3263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 STPG3-AS1-201ENST00000612170 1701 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 CAMK1D-201ENST00000378845 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 MCHR2-201ENST00000281806 2368 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 RPL13P5-202ENST00000412023 1438 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 TMEM234-201ENST00000309777 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 SLC25A48-202ENST00000412661 1148 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 ST6GALNAC4P1-201ENST00000435385 499 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 KLK12-205ENST00000529888 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 AC013467.2-201ENST00000605472 835 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 NFIB-212ENST00000622520 1274 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 KDM8-202ENST00000441782 1612 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 CCDC188-201ENST00000439765 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 KRT17P2-201ENST00000300992 1314 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 LYPLA1-214ENST00000618741 2526 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 DTNBP1-203ENST00000355917 1359 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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CASQ1P31415 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 LCE4A-202ENST00000368777 672 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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CASQ1P31415 MYD88-206ENST00000443433 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 TMEM139-201ENST00000359333 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 TMED7-TICAM2-202ENST00000333314 3453 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 KIF18B-203ENST00000590129 2569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
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CASQ1P31415 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 ATP6AP2-217ENST00000636580 2337 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 LINC00271-201ENST00000421378 1580 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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CASQ1P31415 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 AC097637.2-201ENST00000624096 1997 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
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CASQ1P31415 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 OSBPL6-203ENST00000357080 2217 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
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CASQ1P31415 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 TLE3-202ENST00000440567 2657 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 EPS8L2-218ENST00000530636 2469 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 LENG8-208ENST00000610347 5789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 PPFIBP2-201ENST00000299492 3557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 VKORC1-205ENST00000394975 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 DHRS4L2-202ENST00000397071 1117 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 STARP1-201ENST00000397973 869 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 NKTR-203ENST00000442970 646 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 AL359075.1-203ENST00000462729 1002 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 AL441883.1-201ENST00000566170 1045 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 SHBG-211ENST00000574539 938 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 ZNF772-206ENST00000600175 737 ntTSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 AL138831.2-201ENST00000606564 490 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 CHRFAM7A-203ENST00000401522 1913 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
CASQ1P31415 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
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