Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 OR10H5-201ENST00000308940 1132 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 B4GALT1-AS1-202ENST00000442432 843 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 AP000344.1-201ENST00000454268 641 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 AP000344.1-202ENST00000457193 586 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 ERCC5-207ENST00000535557 1125 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 C1QTNF1-205ENST00000578229 1294 ntTSL 4 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 MIR3652-201ENST00000579335 131 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 SEPT11-203ENST00000502584 2615 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 KRT8P10-201ENST00000450021 1447 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 KCNT1-214ENST00000631073 3948 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 ZNF296-202ENST00000622376 1631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 OSGIN1-203ENST00000393306 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 KANK2-201ENST00000586659 5162 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 MYB-201ENST00000316528 3571 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 MYB-241ENST00000616088 3573 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 AC003669.1-201ENST00000334569 611 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 NEURL2-201ENST00000372518 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 RGS19-202ENST00000395042 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 GGT1-204ENST00000401885 968 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 GNB1L-203ENST00000405009 1076 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 NFATC4-204ENST00000424781 5488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 THAP5-204ENST00000438865 868 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 ICAM2-203ENST00000449662 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 NMU-205ENST00000511469 756 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 AC004080.2-201ENST00000523331 556 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 GZMM-202ENST00000592501 941 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 TP53I11-223ENST00000627720 195 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 AL732314.6-201ENST00000627721 484 ntTSL 4 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 SETD3-209ENST00000630307 1281 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 C17orf100-201ENST00000542475 1756 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 PMS1-212ENST00000432292 3234 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 MYLK2-201ENST00000375985 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 RASL11A-201ENST00000241463 1543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 NEDD4-202ENST00000435532 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 AL021920.2-201ENST00000624828 1351 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 AFF4-201ENST00000265343 9552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 SLC12A9-202ENST00000415287 1912 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 NABP2-201ENST00000267023 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 FAM104A-201ENST00000403627 2798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 C18orf25-203ENST00000615052 5462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 CDKN1C-201ENST00000380725 1220 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
ATP5DP30049 NUS1P2-201ENST00000417358 873 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.7 ms