Protein–RNA interactions for Protein: P28827

PTPRM, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase mu, humanhuman

Predictions only

Length 1,452 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRMP28827 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 FKBP10-201ENST00000321562 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 C16orf45-201ENST00000300006 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 C18orf8-208ENST00000590868 2002 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 ADAMTS10-205ENST00000595838 2458 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 FPGS-201ENST00000373225 2278 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 SDHA-204ENST00000504309 2067 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 FBXO44-203ENST00000376760 822 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 SNHG17-201ENST00000413755 648 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 AC008267.1-201ENST00000474858 1069 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 AC115284.1-201ENST00000488257 547 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 EVX1-AS-202ENST00000519050 576 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 TGIF2-C20orf24-201ENST00000558530 918 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 AC005746.1-201ENST00000589244 672 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 RXRB-202ENST00000374685 2846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 FAM90A1-201ENST00000307435 2342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC23.91■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 SLC39A6-202ENST00000440549 1657 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 LMNA-207ENST00000368301 2461 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 AWAT1-201ENST00000374521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 RNF34-201ENST00000361234 2066 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 SDHAF4-201ENST00000370474 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 CLIC1-206ENST00000375779 1127 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 C15orf48-202ENST00000396650 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 AC011474.2-201ENST00000579268 543 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 GBA2-201ENST00000378088 1672 ntTSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 SLC39A3-202ENST00000455372 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 NTMT1-204ENST00000372486 1487 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 UVSSA-208ENST00000511563 1494 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 MSTO2P-201ENST00000314835 1709 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 HMBS-203ENST00000442944 1548 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 LONP1-215ENST00000593119 2918 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 MYL12B-201ENST00000237500 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 RHCE-202ENST00000340849 1087 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 AC234644.1-201ENST00000406065 370 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 GDAP1-202ENST00000434412 1228 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 AC073573.1-201ENST00000550908 481 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 HOTAIR-201ENST00000424518 2421 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC23.89■■□□□ 1.42
PTPRMP28827 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 GPT-202ENST00000394955 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 FBXL20-202ENST00000394294 2309 ntTSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 ZNF815P-201ENST00000421890 1352 ntTSL 2 BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 CBY1-201ENST00000216029 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 NAT8-201ENST00000272425 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 HYAL3-206ENST00000513170 636 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 C11orf98-202ENST00000525675 405 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 MRFAP1-205ENST00000617365 2112 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 AL021997.3-201ENST00000621053 557 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 AC093326.2-201ENST00000640770 729 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 ABCG4-206ENST00000622721 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 TMEM175-201ENST00000264771 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 ARMC10-209ENST00000454559 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 ARSA-201ENST00000216124 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 SLC22A4-201ENST00000200652 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 ELP5-214ENST00000574993 2209 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 QKI-207ENST00000453779 5685 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 CTSH-201ENST00000220166 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 TSPO-201ENST00000329563 955 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 HIST1H4J-201ENST00000355057 373 ntAPPRIS P1 BASIC23.87■■□□□ 1.41
PTPRMP28827 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.3 ms