Protein–RNA interactions for Protein: P25391

LAMA1, Laminin subunit alpha-1, humanhuman

Predictions only

Length 3,075 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMA1P25391 GNAL-204ENST00000535121 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 KLHDC8A-205ENST00000539253 2931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 AC004597.1-201ENST00000595525 561 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 CDK16-223ENST00000622098 2968 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 DPF2-205ENST00000528416 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 RELA-227ENST00000615805 2236 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 TLE2-201ENST00000262953 2705 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 HPCAL1-208ENST00000622018 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 WNT5B-201ENST00000310594 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 FAM53B-AS1-202ENST00000448422 1491 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 AC244093.1-201ENST00000610837 814 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 AL033527.5-202ENST00000641632 1098 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 BCS1L-205ENST00000412366 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 DENND5B-201ENST00000354285 3132 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 PRPSAP2-216ENST00000536323 1872 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 PPIF-201ENST00000225174 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 WSB2-202ENST00000441406 1353 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 PSENEN-202ENST00000587708 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 SEPHS1-201ENST00000327347 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 ODF2-204ENST00000372814 2249 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 MCHR2-202ENST00000369212 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 TMEM214-201ENST00000238788 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 TMEM225B-203ENST00000453227 1041 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 AC068587.10-201ENST00000641210 219 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 PHGDH-202ENST00000369409 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 MIPEP-201ENST00000382172 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 AC092337.1-201ENST00000568699 1129 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 RABEP2-202ENST00000358201 2821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 GPHB5-201ENST00000314140 393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 PSORS1C3-201ENST00000412143 593 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 RAB34-206ENST00000415040 1293 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 ZNF815P-202ENST00000422825 805 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 TAF8-204ENST00000456846 1293 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 IP6K1-203ENST00000460540 1260 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 AC104989.1-201ENST00000519711 778 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 TBP-206ENST00000540980 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 AC010186.2-201ENST00000575094 2612 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 CYP2S1-201ENST00000310054 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 ABCC3-202ENST00000427699 1881 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 MRNIP-202ENST00000376931 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 IQCF3-201ENST00000437810 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 KRT223P-202ENST00000449164 1292 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 TPRX2P-201ENST00000535362 881 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 DOK5-201ENST00000262593 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 BAG3-201ENST00000369085 2571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
LAMA1P25391 DPEP1-203ENST00000421184 1647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 PCDH8P1-201ENST00000428983 2773 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 NCAPH2-202ENST00000395698 1388 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 PARP8-206ENST00000503665 572 ntTSL 4 BASIC16.02■□□□□ 0.15
LAMA1P25391 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.8 ms