Protein–RNA interactions for Protein: P23468

PTPRD, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase delta, humanhuman

Predictions only

Length 1,912 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPRDP23468 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 C1orf56-201ENST00000368926 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 GDPD3-202ENST00000406256 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 DPP9-AS1-201ENST00000381796 3071 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 UBTF-202ENST00000343638 4684 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 LINC01273-201ENST00000411453 685 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 AL391261.2-201ENST00000554907 773 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 MPI-209ENST00000564003 1195 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 PTPRM-211ENST00000580170 5941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 GRAMD4P3-201ENST00000621665 1669 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 CD244-203ENST00000368034 2463 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 WBP2-204ENST00000585462 1895 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 PEPD-202ENST00000397032 1754 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 ATP11A-AS1-201ENST00000446442 2192 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 MIR943-201ENST00000401286 94 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 EFHD1-202ENST00000409613 1156 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 AZGP1P1-201ENST00000411909 902 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 AL732437.1-201ENST00000442008 595 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 LMO7-AS1-202ENST00000568735 467 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 DIP2A-204ENST00000457905 3044 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 MIER1-205ENST00000371014 1728 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC17.12■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 DKKL1-201ENST00000221498 1222 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 PAX5-207ENST00000446742 885 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 KLK3-204ENST00000593997 1035 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 TOM1L1-221ENST00000575882 2507 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 ANKRD28-201ENST00000399451 6564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 ACAP1-201ENST00000158762 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 AIFM3-202ENST00000399167 2387 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 AIFM3-207ENST00000440238 2368 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 PFKP-202ENST00000381075 2769 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 NT5C3A-204ENST00000405342 1759 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 DYNLL1-201ENST00000242577 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 CD8B-201ENST00000331469 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 FAM207CP-201ENST00000443486 507 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 COQ7-202ENST00000544894 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 AC026803.2-201ENST00000599784 819 ntTSL 3 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 LAT-202ENST00000360872 1459 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 FBXO22-202ENST00000453211 1486 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 SLC9A1-203ENST00000374086 2183 ntTSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 LINC02268-202ENST00000515444 1328 ntTSL 2 BASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 NKILA-202ENST00000614771 2598 ntBASIC17.11■□□□□ 0.33
PTPRDP23468 IGLON5-201ENST00000270642 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.11■□□□□ 0.33
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