Protein–RNA interactions for Protein: P19876

CXCL3, C-X-C motif chemokine 3, humanhuman

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Length 107 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CXCL3P19876 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 ROR2-202ENST00000375715 2993 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 MTG1-201ENST00000317502 1560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 TUBB6-211ENST00000591208 1492 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 TNFSF13-202ENST00000349228 2036 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 ZBTB10-203ENST00000430430 10132 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 CHRNB4-202ENST00000412074 1355 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 THAP3-201ENST00000054650 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 AC005885.1-204ENST00000637885 2885 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 ENDOV-204ENST00000518137 2815 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 HAS3-201ENST00000219322 1163 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 LINC01743-201ENST00000366308 964 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 LINC01122-201ENST00000422723 675 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 GRAMD1B-209ENST00000533341 707 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 AL513523.10-201ENST00000623024 1186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 ACOX3-203ENST00000503233 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 TAPBPL-201ENST00000266556 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 SYBU-207ENST00000433638 3104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 AL135999.2-201ENST00000622438 1686 ntBASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 ASTN2-206ENST00000361477 4001 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 P2RX5-209ENST00000552276 1642 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 LRRC47-201ENST00000378251 4310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 RAB2A-201ENST00000262646 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
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CXCL3P19876 PSD2-201ENST00000274710 4513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
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CXCL3P19876 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 IFT52-201ENST00000373030 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 LINC00926-201ENST00000501726 2530 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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CXCL3P19876 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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CXCL3P19876 PPP1R12A-AS1-201ENST00000552885 3234 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 MLEC-201ENST00000228506 6626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
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CXCL3P19876 TMEM191C-214ENST00000621561 1337 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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CXCL3P19876 C1QBP-201ENST00000225698 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 PFDN6-201ENST00000374606 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 TNNT3-206ENST00000381579 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 IGHV3-73-201ENST00000390636 437 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 FAM131A-208ENST00000453072 1038 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 AC098864.1-204ENST00000513752 805 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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CXCL3P19876 SLC27A4-202ENST00000372870 1557 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 WBP4-201ENST00000379487 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 ABO-203ENST00000611156 1577 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 AL137784.3-201ENST00000623858 2288 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
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CXCL3P19876 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 MEIS3-210ENST00000561096 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 SOX7-201ENST00000304501 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 FUT8-AS1-201ENST00000621019 1521 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 BUD13-201ENST00000260210 2196 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 ALOX15B-205ENST00000573359 1809 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 FZR1-202ENST00000395095 1491 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 HTR1A-201ENST00000323865 1778 ntAPPRIS P1 BASIC13.99□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 ARPC1B-211ENST00000451682 1715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
CXCL3P19876 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.98□□□□□ -0.17
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