Protein–RNA interactions for Protein: P19387

POLR2C, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 275 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2CP19387 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 AC022145.2-201ENST00000598203 171 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 FSTL3-207ENST00000605925 748 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 OPCML-202ENST00000374778 1302 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 LINC02138-201ENST00000378340 1326 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 IFFO1-211ENST00000615885 2775 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 AKIRIN1-202ENST00000432648 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 KCNK9-203ENST00000520439 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 SPATC1L-201ENST00000291672 2303 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 PHF19-201ENST00000312189 836 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 HSD17B8-203ENST00000374662 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 PRORY-201ENST00000382764 878 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 AP002490.2-201ENST00000524791 560 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 OTUB2-202ENST00000553723 708 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 FAM227B-204ENST00000558594 1139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 AC004835.2-201ENST00000603762 682 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 SCOC-211ENST00000614192 1959 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 ZSCAN10-207ENST00000575108 2247 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 QRICH2-205ENST00000636395 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 TSC22D1-AS1-201ENST00000616360 2845 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 SLFNL1-205ENST00000439569 2117 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 NMD3-202ENST00000460469 3061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 LBX1-AS1-201ENST00000430651 2553 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 INPP5J-213ENST00000620191 2306 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 RTN3-205ENST00000356000 2645 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 ALKBH6-201ENST00000252984 955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 WDR53-204ENST00000433160 887 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 AC002116.1-201ENST00000473572 1130 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 CSK-210ENST00000567571 2443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 MAP3K8-207ENST00000542547 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 RUNX2-201ENST00000359524 5390 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
POLR2CP19387 ZNF354C-201ENST00000315475 5411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms