Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 LINC01413-201ENST00000564843 772 ntTSL 3 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 FGFR3-208ENST00000481110 4217 ntTSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 HOXA10-202ENST00000396344 1570 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.72■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 ZDHHC4-206ENST00000405731 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 ASH1L-207ENST00000548830 1862 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 SEC23A-203ENST00000545328 2734 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 EWSAT1-206ENST00000558922 1725 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 ZIC5-201ENST00000267294 4639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 RAMP1-201ENST00000254661 910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 TSTD1-203ENST00000368024 457 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 SNCA-209ENST00000506244 570 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 CTBP1-AS2-204ENST00000514984 533 ntTSL 4 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 HELT-204ENST00000515777 841 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 AC109635.5-201ENST00000533593 962 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 ZNF773-202ENST00000593916 548 ntTSL 3 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 FAM53C-202ENST00000434981 1686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 PCDHA14-201ENST00000506751 2298 ntBASIC16.71■□□□□ 0.27
CTPS1P17812 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 NFE2L3-201ENST00000056233 3686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 SPSB1-202ENST00000357898 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 PLXNB3-201ENST00000361971 6146 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 MTDH-201ENST00000336273 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 TBC1D30-203ENST00000539867 2594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 ZBTB45-201ENST00000354590 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 ZNF385A-212ENST00000551109 2369 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 NR2C1-219ENST00000622476 1561 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 RFXANK-202ENST00000392324 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 AP000695.1-201ENST00000429588 893 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 AL671277.1-201ENST00000429656 993 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 TTC31-205ENST00000442235 958 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 LINC01485-205ENST00000523617 586 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 KRT16P2-202ENST00000579062 563 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 MIR3909-201ENST00000579518 119 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 AC021097.1-201ENST00000607902 574 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 PLXND1-201ENST00000324093 7094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 SPG7-201ENST00000268704 3076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
CTPS1P17812 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 37.5 ms