Protein–RNA interactions for Protein: P17483

HOXB4, Homeobox protein Hox-B4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 251 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXB4P17483 SLC22A5-203ENST00000435065 1746 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 PCCB-201ENST00000251654 1833 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 UBE3D-203ENST00000369747 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 FZD10-202ENST00000539839 3282 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 LOXL3-205ENST00000409986 2005 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 HFE2-201ENST00000336751 2234 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 CNNM3-201ENST00000305510 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 PSMG3-203ENST00000404674 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 AC007731.4-201ENST00000420225 652 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 RHOXF1P1-201ENST00000454625 772 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 GUSBP2-202ENST00000479900 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 MRPL52-208ENST00000553711 586 ntTSL 3 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 AC243964.2-202ENST00000591312 752 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 AC133552.6-201ENST00000613406 534 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 AL109936.8-201ENST00000641772 604 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 RAD51D-201ENST00000335858 1353 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 AC020907.1-201ENST00000616460 1350 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 PIP5K1A-207ENST00000441902 2297 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 ESYT2-206ENST00000613624 2766 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 ARHGEF18-201ENST00000319670 5212 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 TLE2-217ENST00000590536 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 C8orf34-206ENST00000518698 2223 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 SPNS1-202ENST00000323081 2102 ntTSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 UGP2-202ENST00000394417 2136 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 HDAC10-205ENST00000448072 2133 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
HOXB4P17483 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 TES-201ENST00000358204 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 CD99P1-204ENST00000435581 2788 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 SCARB2-223ENST00000640640 4608 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 ARHGAP22-205ENST00000417912 2352 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 PAX7-201ENST00000375375 2260 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 PTDSS1-202ENST00000517309 5177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 EPHA10-201ENST00000319637 2050 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 RAB5C-201ENST00000346213 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 STRN4-204ENST00000539396 2608 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 PCDHGC3-205ENST00000617641 2346 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 UBAP1L-201ENST00000502113 1381 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 ATOH1-201ENST00000306011 2212 ntAPPRIS P1 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 MUM1-216ENST00000627377 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 FOXR1-201ENST00000317011 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 BEX3-203ENST00000372635 805 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 NDUFAF3-203ENST00000395458 808 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 AL391335.1-201ENST00000504583 535 ntTSL 4 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 LINC02437-201ENST00000505053 911 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 RN7SL219P-201ENST00000582872 296 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 PHYH-202ENST00000396913 1732 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 GLIS1-202ENST00000628545 2807 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 PRPF19-201ENST00000227524 2157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 KCNA7-201ENST00000221444 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 INSIG1-203ENST00000344756 2623 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 EPHX2-204ENST00000518379 1959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 ZNF470-201ENST00000330619 7151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 PRRT4-205ENST00000489835 2313 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 OPRD1-201ENST00000234961 9345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 COQ6-201ENST00000334571 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 BBS7-204ENST00000506636 2570 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 RARA-206ENST00000425707 3041 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC13.88□□□□□ -0.19
HOXB4P17483 DCHS2-201ENST00000339452 5064 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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