Protein–RNA interactions for Protein: P16619

CCL3L1, C-C motif chemokine 3-like 1, humanhuman

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCL3L1P16619 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.74□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 TERT-202ENST00000334602 3210 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 VPS54-201ENST00000272322 3463 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 TACC3-201ENST00000313288 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 HNRNPLL-202ENST00000358367 2779 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 LINC00323-202ENST00000441268 2095 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 GABARAPL1-205ENST00000539170 1700 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 SYCE1-203ENST00000368517 1377 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 STAT5A-207ENST00000546010 3086 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 ZNF133-204ENST00000396026 2717 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 LMBR1-202ENST00000359422 4727 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 FBXO18-203ENST00000397269 3640 ntTSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 FAM222B-211ENST00000582266 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 AP004609.1-201ENST00000498872 1646 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 MRPL9-202ENST00000368830 1296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 ADARB2-201ENST00000381305 703 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CCL3L1P16619 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 TMUB1-204ENST00000476627 882 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CCL3L1P16619 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CCL3L1P16619 C1QTNF1-202ENST00000339142 3100 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 TAPBP-233ENST00000426633 1888 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 SDCBP-201ENST00000260130 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 SDCBP2-202ENST00000360779 1519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CCL3L1P16619 SLC5A10-204ENST00000395647 2140 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 REL-202ENST00000394479 2398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
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CCL3L1P16619 RUNX1-201ENST00000300305 6222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CCL3L1P16619 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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CCL3L1P16619 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 ARHGEF25-208ENST00000616622 2103 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 PDXP-202ENST00000403251 1571 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 CRTC3-202ENST00000420329 5209 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 PHF1-202ENST00000374516 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 TYROBP-201ENST00000262629 568 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 PMP22-202ENST00000395936 816 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 MOB1B-202ENST00000396051 1107 ntTSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 GSTK1-207ENST00000479303 1185 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 AC116021.1-201ENST00000530049 653 ntTSL 3 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 AL137786.1-202ENST00000555496 789 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 AC126696.3-201ENST00000563993 575 ntTSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 DCTPP1-203ENST00000567983 801 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
CCL3L1P16619 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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