Protein–RNA interactions for Protein: P16219

ACADS, Short-chain specific acyl-CoA dehydrogenase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACADSP16219 APAF1-203ENST00000359972 7029 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 NBPF9-207ENST00000615421 5835 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 KLK14-201ENST00000156499 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 PIEZO1-202ENST00000327397 1246 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 FAM8A6P-201ENST00000407496 1135 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 TSPY5P-201ENST00000426936 936 ntBASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 TMA7-201ENST00000438607 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 AC134772.1-201ENST00000438872 885 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 AC012618.3-202ENST00000440004 472 ntTSL 4 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 PTX4-202ENST00000440447 1117 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 SNX5-210ENST00000481323 562 ntTSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 RARRES2-205ENST00000482669 563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 OAF-202ENST00000531220 815 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 ZNF655-203ENST00000357864 1370 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 FASTK-202ENST00000353841 1402 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 ABHD11-205ENST00000437775 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 TMEM82-201ENST00000375782 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 CRYL1-202ENST00000382812 1581 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 KRT35-201ENST00000246639 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 OVOL1-203ENST00000532448 1774 ntTSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 GLIDR-204ENST00000638724 1765 ntTSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 SMARCD2-202ENST00000323347 1935 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 IL9R-202ENST00000369423 2032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 ANKRD26-201ENST00000376087 6591 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 MYH14-210ENST00000601313 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 HTR7-201ENST00000277874 3028 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 DIAPH2-204ENST00000373054 3376 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 SYAP1-201ENST00000380155 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
ACADSP16219 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 SBF1-201ENST00000348911 6045 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 PDE4A-203ENST00000380702 4781 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 NF1-211ENST00000487476 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 CLEC18A-201ENST00000288040 2155 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 NSUN5P2-205ENST00000602348 1776 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 NFKBID-210ENST00000606253 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 DPF3-204ENST00000546183 1514 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 TLX2-204ENST00000621092 1452 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 IFNL4-204ENST00000634967 1493 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 LAT-204ENST00000395461 1448 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 C6orf203-202ENST00000405204 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 NUCKS1-201ENST00000367142 6496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 LCE3C-201ENST00000333881 425 ntAPPRIS P1 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 HES2-202ENST00000377836 507 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 AK4P3-201ENST00000418260 669 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 AC004080.5-201ENST00000498652 368 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 HELT-202ENST00000505610 846 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 AC021087.1-201ENST00000512642 522 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 AC012213.1-202ENST00000523422 449 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 AP005717.1-202ENST00000523563 419 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 PPOX-219ENST00000544598 813 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 MRPL52-210ENST00000555345 895 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 CDKN3-209ENST00000556102 938 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 TK1-205ENST00000590862 642 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 AC239803.1-201ENST00000594189 1278 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 RPARP-AS1-206ENST00000596366 631 ntTSL 3 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 AC092902.2-222ENST00000626312 568 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 ELFN1-202ENST00000561626 3742 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 RASGRF2-206ENST00000638442 2842 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 AC126755.1-201ENST00000525846 6405 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 TRIM45-201ENST00000256649 3515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
ACADSP16219 PPP1R37-201ENST00000221462 3163 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.1 ms