Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 DIABLO-208ENST00000464942 2569 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 NFKBIA-201ENST00000216797 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 RNF150-201ENST00000306799 4535 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 PTPN11-201ENST00000351677 6101 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 FGF4-201ENST00000168712 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 GCLM-201ENST00000370238 4857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.76□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 KXD1-201ENST00000222307 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 ACY1-206ENST00000476351 1409 ntTSL 3 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 NPRL3-211ENST00000611875 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 ELMO1-209ENST00000448602 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 IDH3G-201ENST00000217901 1485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 CRY1-201ENST00000008527 3267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 MFSD1-203ENST00000415822 2423 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 TMEM237-202ENST00000409444 5592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 ASIC1-201ENST00000228468 4072 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 NMRK1-202ENST00000376808 1121 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 RBCK1-206ENST00000400247 790 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AC008105.2-201ENST00000420431 579 ntTSL 4 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 CSRP1-214ENST00000531916 890 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 MIR22HG-204ENST00000571595 767 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 IL11-204ENST00000590625 1028 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AL590326.2-201ENST00000625139 305 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 TPCN1-201ENST00000335509 5274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 TPD52L2-204ENST00000351424 2302 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 SLC27A5-201ENST00000263093 2361 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 THNSL2-202ENST00000343544 2052 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 FAM53A-201ENST00000308132 2802 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 NSMF-205ENST00000371474 3571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 NSMF-208ENST00000437259 3577 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.75□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 NPNT-201ENST00000305572 3003 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 ANKFY1-202ENST00000570535 6458 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 TRIM14-201ENST00000341469 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
VPREB1P12018 SHROOM2-201ENST00000380913 7447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.74□□□□□ -0.69
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.7 ms