Protein–RNA interactions for Protein: P11215

ITGAM, Integrin alpha-M, humanhuman

Predictions only

Length 1,152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGAMP11215 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 RGL3-201ENST00000380456 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 GGT5-203ENST00000398292 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 FNDC8-201ENST00000158009 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 HUS1B-201ENST00000380907 1025 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 JMJD7-203ENST00000408047 1192 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 MCCD1P2-201ENST00000423228 335 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 AC105202.1-202ENST00000522060 834 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 AC002091.2-201ENST00000585297 402 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 AC243773.2-203ENST00000612281 640 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 IL12RB1-201ENST00000322153 1902 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 PPT2-246ENST00000375137 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 ELN-221ENST00000445912 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 SAMM50-201ENST00000350028 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 ADM5-201ENST00000420022 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 ACTN4-201ENST00000252699 4963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 PEX6-202ENST00000304611 3478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 AL662844.4-201ENST00000606367 2838 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 UBE2G1-204ENST00000572484 1514 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 CBX3P2-201ENST00000579647 1429 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 PHF12-205ENST00000577226 7679 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 GABRB2-202ENST00000353437 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 NR4A1-204ENST00000394825 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 AL590627.1-201ENST00000626603 1910 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 MYH14-202ENST00000376970 6787 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 SURF4-209ENST00000618229 3200 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 HCCS-203ENST00000380763 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 MRPS12-203ENST00000407800 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 CPSF1-207ENST00000531727 704 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 SPATA33-208ENST00000568929 1264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 CYB561-216ENST00000582297 897 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 OR5AH1P-202ENST00000597822 431 ntTSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 FAM83G-201ENST00000345041 2929 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 SBNO2-204ENST00000587024 4861 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 UBQLN1-201ENST00000257468 2299 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 LINC00942-201ENST00000515614 2417 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 TMED9-201ENST00000332598 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 QRFPR-202ENST00000394427 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 TMEM177-201ENST00000272521 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 LITAF-202ENST00000381810 1527 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 PTEN-201ENST00000371953 9027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 ZC3H12A-201ENST00000373087 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 ARVCF-204ENST00000406522 2682 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 PARK7-203ENST00000377491 977 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 RPS8P6-201ENST00000426177 609 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 LHX5-AS1-201ENST00000551357 522 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 AC096734.2-201ENST00000562054 433 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 AC092115.3-201ENST00000575838 592 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 ACYP2-209ENST00000607452 831 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 CHST14-201ENST00000306243 3574 ntAPPRIS P1 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 PLPPR4-202ENST00000370185 5369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 PIGT-221ENST00000638594 1835 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 FAM153A-203ENST00000440605 1966 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
ITGAMP11215 CLN3-203ENST00000357806 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.2 ms