Protein–RNA interactions for Protein: P07196

NEFL, Neurofilament light polypeptide, humanhuman

Predictions only

Length 543 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEFLP07196 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFLP07196 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFLP07196 RER1-209ENST00000605895 3044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFLP07196 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFLP07196 APBB1-224ENST00000621678 1907 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFLP07196 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFLP07196 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFLP07196 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFLP07196 SLC6A13-201ENST00000343164 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFLP07196 C6orf48-204ENST00000375639 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFLP07196 SMIM11A-202ENST00000399295 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFLP07196 AC037459.1-202ENST00000430850 531 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFLP07196 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFLP07196 RAB29-205ENST00000446390 1441 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFLP07196 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFLP07196 PHF11-218ENST00000496623 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFLP07196 STK19B-204ENST00000512515 211 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFLP07196 CDC42EP2-202ENST00000533419 1279 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFLP07196 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFLP07196 AL049780.2-201ENST00000556236 367 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFLP07196 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFLP07196 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFLP07196 SMIM11B-207ENST00000624758 1074 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFLP07196 MEN1-207ENST00000377326 3150 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFLP07196 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFLP07196 MUL1-201ENST00000264198 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFLP07196 SLC25A33-201ENST00000302692 3854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFLP07196 ZDHHC20-201ENST00000320220 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFLP07196 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFLP07196 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
NEFLP07196 WDR18-204ENST00000587001 1465 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEFLP07196 ARHGAP9-201ENST00000393791 2597 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEFLP07196 KIAA1755-206ENST00000496900 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEFLP07196 TLL1-201ENST00000061240 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEFLP07196 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEFLP07196 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEFLP07196 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEFLP07196 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEFLP07196 HLA-DMA-201ENST00000374843 1123 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEFLP07196 ECEL1P3-201ENST00000427961 737 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NEFLP07196 AL645941.2-201ENST00000429234 612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEFLP07196 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NEFLP07196 SLC25A11-202ENST00000544061 952 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEFLP07196 SLC39A2-203ENST00000554422 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEFLP07196 RSPO1-203ENST00000612451 2463 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEFLP07196 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEFLP07196 COMP-203ENST00000542601 2707 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEFLP07196 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEFLP07196 AC002310.6-201ENST00000624451 1377 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
NEFLP07196 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEFLP07196 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEFLP07196 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
NEFLP07196 EML4-201ENST00000318522 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEFLP07196 PCNX1-202ENST00000439984 6988 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEFLP07196 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEFLP07196 KIAA1468-202ENST00000398130 6178 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEFLP07196 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEFLP07196 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEFLP07196 LINC01529-205ENST00000637365 2000 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEFLP07196 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEFLP07196 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEFLP07196 PFN1-201ENST00000225655 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEFLP07196 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEFLP07196 TMSB4X-201ENST00000380633 495 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEFLP07196 MRPL23-201ENST00000381514 919 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEFLP07196 AC098829.1-201ENST00000502344 630 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEFLP07196 AL354712.1-201ENST00000563570 477 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEFLP07196 NAA38-203ENST00000575071 553 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEFLP07196 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEFLP07196 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEFLP07196 HNF1A-211ENST00000543427 2819 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
NEFLP07196 NPHP4-201ENST00000378156 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEFLP07196 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEFLP07196 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEFLP07196 DNM1P51-202ENST00000558801 8752 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEFLP07196 TBXAS1-201ENST00000336425 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEFLP07196 KIF1C-201ENST00000320785 7919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEFLP07196 RUNX1T1-246ENST00000523629 7537 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.12
NEFLP07196 HOGA1-202ENST00000370646 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFLP07196 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFLP07196 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFLP07196 DNAH14-206ENST00000400952 1984 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFLP07196 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFLP07196 MGEA5-201ENST00000357797 3263 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFLP07196 MDFI-202ENST00000373050 809 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFLP07196 DMKN-215ENST00000451297 1111 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFLP07196 AC004080.6-201ENST00000467897 919 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFLP07196 KCNIP3-205ENST00000468529 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFLP07196 AC019068.1-202ENST00000483218 768 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFLP07196 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFLP07196 LY6E-211ENST00000521699 1256 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFLP07196 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFLP07196 AL132780.2-201ENST00000557615 1021 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFLP07196 ZNF444P1-201ENST00000559497 298 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFLP07196 LIMD2-211ENST00000583211 1298 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFLP07196 GPR32P1-201ENST00000601788 811 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFLP07196 FAM87A-204ENST00000613235 858 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFLP07196 MALAT1-215ENST00000619449 794 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFLP07196 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
NEFLP07196 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24.8 ms