Protein–RNA interactions for Protein: O96019

ACTL6A, Actin-like protein 6A, humanhuman

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ACTL6AO96019 TTC8-202ENST00000345383 2329 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ACTL6AO96019 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ACTL6AO96019 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTL6AO96019 LUC7L2-202ENST00000354926 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ 0
ACTL6AO96019 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC15.05■□□□□ 0
ACTL6AO96019 NOL4L-211ENST00000621426 6577 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ 0
ACTL6AO96019 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 CTRB2-201ENST00000303037 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 SNHG5-201ENST00000369605 1032 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 C19orf33-202ENST00000588605 520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 PDCD6-214ENST00000628729 1073 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 STARD3NL-204ENST00000434197 1341 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 TMEM86B-201ENST00000327042 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 EIF4A3-201ENST00000269349 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 KLHL33-201ENST00000344581 1863 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 DDX28-201ENST00000332395 2169 ntAPPRIS P1 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 TMEM50B-210ENST00000542230 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 ST6GALNAC6-216ENST00000622357 2396 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 PIAS3-201ENST00000369298 2761 ntTSL 5 BASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.05■□□□□ -0
ACTL6AO96019 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTL6AO96019 ZCCHC18-203ENST00000537356 2907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTL6AO96019 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTL6AO96019 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTL6AO96019 AMMECR1-201ENST00000262844 5504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTL6AO96019 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTL6AO96019 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTL6AO96019 SEPT9-202ENST00000423034 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTL6AO96019 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTL6AO96019 AC079140.1-201ENST00000508039 487 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTL6AO96019 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTL6AO96019 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTL6AO96019 GALNT9-208ENST00000541995 1001 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTL6AO96019 AC090515.4-201ENST00000558042 450 ntTSL 3 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTL6AO96019 AC103808.2-201ENST00000582755 594 ntTSL 4 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTL6AO96019 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTL6AO96019 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTL6AO96019 CTPS2-201ENST00000359276 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTL6AO96019 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTL6AO96019 TSPAN3-201ENST00000267970 6467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTL6AO96019 SMUG1-209ENST00000505128 2607 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTL6AO96019 SCYL1-214ENST00000533862 2570 ntTSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTL6AO96019 SSH1-201ENST00000326470 2432 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTL6AO96019 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTL6AO96019 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTL6AO96019 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.04■□□□□ -0
ACTL6AO96019 ROCK2-209ENST00000616279 6401 ntTSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTL6AO96019 OR6D1P-203ENST00000641209 4860 ntBASIC15.04■□□□□ -0
ACTL6AO96019 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.04■□□□□ -0
ACTL6AO96019 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTL6AO96019 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTL6AO96019 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTL6AO96019 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTL6AO96019 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTL6AO96019 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTL6AO96019 GDF5-202ENST00000374372 2572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTL6AO96019 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTL6AO96019 RSPH6A-201ENST00000221538 2456 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTL6AO96019 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTL6AO96019 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTL6AO96019 MYEOV-203ENST00000535407 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTL6AO96019 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTL6AO96019 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTL6AO96019 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTL6AO96019 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTL6AO96019 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTL6AO96019 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTL6AO96019 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTL6AO96019 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTL6AO96019 METTL21AP1-201ENST00000438852 635 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACTL6AO96019 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTL6AO96019 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC15.03■□□□□ -0
ACTL6AO96019 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTL6AO96019 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTL6AO96019 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
ACTL6AO96019 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.03■□□□□ -0
ACTL6AO96019 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.03■□□□□ -0
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.4 ms