Protein–RNA interactions for Protein: O95833

CLIC3, Chloride intracellular channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC3O95833 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 ACSL1-202ENST00000454703 3636 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 PPP1R16B-201ENST00000299824 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 PDZD4-201ENST00000164640 3689 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 AC106881.1-201ENST00000605849 3329 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 ATP6V0C-201ENST00000330398 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 INPP5F-203ENST00000369081 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 USF2-203ENST00000379134 648 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 GXYLT1P3-201ENST00000453058 1193 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 AC122714.2-201ENST00000502787 707 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 PDCD6-206ENST00000507528 1088 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 PDCD6-207ENST00000509581 1156 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 ISCU-208ENST00000539593 1071 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 AL023973.1-201ENST00000624619 620 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 TBL2-205ENST00000432538 1573 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 ALDH3A1-212ENST00000494157 1572 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 CRK-202ENST00000398970 3675 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 AC023908.3-201ENST00000564211 3047 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 PUF60-208ENST00000526683 2412 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 MAP2K3-202ENST00000342679 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 ZNF620-202ENST00000418905 2022 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 PLA2G15-202ENST00000413021 1346 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 PDE8B-202ENST00000333194 2572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 MPP3-201ENST00000398389 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 RWDD1-202ENST00000466444 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 BCS1L-202ENST00000392109 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 BCS1L-204ENST00000392111 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 AL353593.2-201ENST00000602529 1483 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 CTNND2-214ENST00000511377 4336 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 AC136621.1-201ENST00000624017 2304 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 C1QTNF1-209ENST00000581774 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 AJ239322.1-201ENST00000419362 2209 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 SULT2B1-201ENST00000201586 1295 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 UFSP1-201ENST00000388761 996 ntAPPRIS P1 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 AC068134.1-202ENST00000439072 356 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 AC008429.1-203ENST00000518894 548 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 MIR2117HG-201ENST00000588060 506 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 GPX4-207ENST00000589115 812 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 TARSL2-201ENST00000335968 3610 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 DEPDC5-203ENST00000400242 2395 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 JPT1-203ENST00000409753 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 TOM1-206ENST00000425375 2252 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 MED25-202ENST00000538643 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 C15orf52-202ENST00000397536 4717 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 SYNGAP1-202ENST00000418600 5828 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 KRAS-203ENST00000556131 1696 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 NANOS1-202ENST00000425699 4017 ntAPPRIS P2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 STC2-201ENST00000265087 5353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 CEP104-202ENST00000378230 6424 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 TK2-203ENST00000451102 3738 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 CHFR-204ENST00000443047 2990 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 CCDC110-201ENST00000307588 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 RESP18-201ENST00000333527 795 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CLIC3O95833 ZMYM5-203ENST00000382907 1092 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30 ms