Protein–RNA interactions for Protein: O95754

SEMA4F, Semaphorin-4F, humanhuman

Predictions only

Length 770 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA4FO95754 KIAA0895-208ENST00000440378 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 RBCK1-203ENST00000382181 2208 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 DTX2-211ENST00000446600 2281 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 AIP-201ENST00000279146 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 STOM-203ENST00000538954 1257 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 PPHLN1-221ENST00000552761 1095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 LINC01775-201ENST00000587826 371 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 AC010619.1-201ENST00000599536 675 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 RHOU-201ENST00000366691 4372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 ANKRD13B-209ENST00000614878 2670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 GSS-201ENST00000216951 1922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 PCDHA13-201ENST00000289272 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 DEF6-201ENST00000316637 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 ZNF397-201ENST00000261333 1419 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 AD000671.3-202ENST00000591091 1712 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 RASAL2-AS1-202ENST00000421505 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 LRRC20-203ENST00000358141 2924 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 AATK-201ENST00000326724 5257 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 KCTD2-201ENST00000322444 3635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 CACNA1B-206ENST00000371372 9790 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 CALY-202ENST00000368555 783 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 C1QC-202ENST00000374639 1183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 PSMB8-203ENST00000395339 1025 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 GRAP-202ENST00000395635 834 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 TMPRSS11CP-201ENST00000453277 683 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 CXCL6-203ENST00000515050 557 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 AC243562.3-201ENST00000559866 1212 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 ALKBH7-203ENST00000599849 556 ntTSL 3 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 AL133215.2-201ENST00000609242 977 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 AL844908.2-201ENST00000609461 460 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 AC025048.6-201ENST00000634326 1161 ntBASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 RDH13-223ENST00000610356 1931 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 FAM135A-209ENST00000505769 4806 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 PLPPR2-208ENST00000591608 2552 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 PDZD3-202ENST00000355547 2252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 CLN8-205ENST00000520991 1305 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 TEAD3-204ENST00000639578 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 HEYL-201ENST00000372852 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 LIMS2-217ENST00000545738 1730 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 NR2C2-206ENST00000425241 2494 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 PRRG2-201ENST00000246794 1404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 KREMEN1-203ENST00000407188 1422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 NGLY1-207ENST00000428257 2534 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 NFATC1-210ENST00000587635 2195 ntTSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 MOGS-205ENST00000452063 2568 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 ABCF3-203ENST00000429586 2624 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 NAP1L5-201ENST00000323061 2321 ntAPPRIS P1 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 CORO6-202ENST00000388767 2397 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 KCNJ2-AS1-201ENST00000590966 2442 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 C17orf62-201ENST00000306645 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 C17orf62-203ENST00000434650 2050 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 UBXN1-201ENST00000294119 1291 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 RBM3-202ENST00000376755 1130 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 CIB3-202ENST00000379859 467 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 SNRPB-201ENST00000381342 1154 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 AL161785.2-201ENST00000427080 966 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 AL669831.5-201ENST00000434264 844 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 SNRPB-202ENST00000438552 1008 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
SEMA4FO95754 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.2 ms