Protein–RNA interactions for Protein: O95484

CLDN9, Claudin-9, humanhuman

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Length 217 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLDN9O95484 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 RFXANK-203ENST00000407360 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 HFE-210ENST00000470149 1123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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CLDN9O95484 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 FAM181A-205ENST00000557719 1072 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
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CLDN9O95484 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 RGP1-201ENST00000378078 7018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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CLDN9O95484 AC074117.1-201ENST00000447070 3060 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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CLDN9O95484 RGS11-202ENST00000316163 2376 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
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CLDN9O95484 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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CLDN9O95484 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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CLDN9O95484 GOLGA2P2Y-202ENST00000423852 1506 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
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CLDN9O95484 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 NPC1L1-203ENST00000423141 2554 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 TK2-201ENST00000299697 5114 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
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CLDN9O95484 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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CLDN9O95484 TMC7-201ENST00000304381 3640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
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CLDN9O95484 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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CLDN9O95484 PDE6D-202ENST00000409772 672 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 ATP6V0CP3-201ENST00000417255 467 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 LINC01503-203ENST00000436710 901 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 PPIE-208ENST00000470213 927 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 RNASET2-206ENST00000476238 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 AC092910.1-201ENST00000482027 1129 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
CLDN9O95484 FIBP-212ENST00000533045 1173 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
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