Protein–RNA interactions for Protein: O75461

E2F6, Transcription factor E2F6, humanhuman

Predictions only

Length 281 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F6O75461 GNAO1-201ENST00000262493 3337 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 SUCO-210ENST00000616058 5495 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 SOGA3-201ENST00000465909 3756 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 ZNF165-201ENST00000377325 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 LARP4-210ENST00000522085 1577 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AC009336.1-201ENST00000608941 1553 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
E2F6O75461 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 SLC35E2B-203ENST00000611123 5948 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 LINC00910-206ENST00000592135 2438 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AC025165.1-201ENST00000356672 2355 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 PODN-202ENST00000371500 3287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 IRF5-210ENST00000477535 1374 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 SLC35C2-204ENST00000372230 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 LY6E-203ENST00000517503 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 CLN6-202ENST00000538696 1343 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 CREB3L3-201ENST00000078445 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 SYNGAP1-203ENST00000428982 4339 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 CD320-201ENST00000301458 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 FMR1-202ENST00000334557 1295 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 KRTAP5-10-201ENST00000398531 1176 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 MOGAT1-201ENST00000446656 1048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AC136628.4-201ENST00000520758 535 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 CUL7-203ENST00000535468 5504 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 TMEM191A-211ENST00000637163 1067 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 CHEK1-202ENST00000427383 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 PATZ1-204ENST00000405309 3711 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 LINC00029-201ENST00000370341 1631 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 KRBOX4-202ENST00000344302 2774 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 SDCBP2-204ENST00000381812 1550 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 RFK-201ENST00000376736 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 FTSJ1-202ENST00000348411 1892 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 CELF4-202ENST00000361795 1853 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 ZNF516-201ENST00000443185 8118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
E2F6O75461 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F6O75461 OTX1-201ENST00000282549 2861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F6O75461 OTX1-202ENST00000366671 2861 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F6O75461 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F6O75461 ACSL3-202ENST00000392066 3147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F6O75461 RALGPS2-204ENST00000367635 5834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AP002414.2-201ENST00000591780 3365 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F6O75461 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F6O75461 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F6O75461 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F6O75461 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F6O75461 NRN1-201ENST00000244766 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F6O75461 GHRHR-201ENST00000326139 1602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F6O75461 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AIFM2-202ENST00000373248 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F6O75461 MPC2-201ENST00000271373 798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F6O75461 BAD-201ENST00000309032 929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F6O75461 ZNF575-201ENST00000314228 1298 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F6O75461 FAM220CP-201ENST00000395253 831 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F6O75461 ICAM1-202ENST00000423829 1296 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F6O75461 COX11P1-201ENST00000489116 835 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F6O75461 FOXP3-205ENST00000518685 1213 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AC006942.1-201ENST00000600669 520 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AL390719.2-201ENST00000606993 987 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F6O75461 AC073912.3-201ENST00000624414 853 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F6O75461 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
E2F6O75461 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F6O75461 MAMLD1-203ENST00000370401 4854 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F6O75461 PCDH17-201ENST00000377918 8232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F6O75461 PPP3CB-201ENST00000342558 2418 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F6O75461 MLLT6-210ENST00000620609 2714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F6O75461 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F6O75461 PPM1B-204ENST00000378551 3877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F6O75461 POLD4-205ENST00000529704 1486 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F6O75461 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F6O75461 BLK-205ENST00000529894 2017 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F6O75461 USP19-203ENST00000398892 4622 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F6O75461 NEURL1-201ENST00000369780 4314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F6O75461 PPP3CA-207ENST00000512215 4007 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F6O75461 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
E2F6O75461 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 ZFR2-201ENST00000262961 4756 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
E2F6O75461 COTL1-203ENST00000564057 1677 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.2 ms