Protein–RNA interactions for Protein: O75182

SIN3B, Paired amphipathic helix protein Sin3b, humanhuman

Predictions only

Length 1,162 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SIN3BO75182 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 CETN1-201ENST00000327228 1758 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 RNF165-204ENST00000587853 2011 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SIN3BO75182 AC068831.1-204ENST00000501381 1621 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 AL162586.1-201ENST00000439298 2055 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 GOSR1-201ENST00000225724 6039 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 CPXM1-201ENST00000380605 2391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 FBXO24-206ENST00000468962 1901 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 TMEM179B-201ENST00000333449 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 CRLF2-202ENST00000381567 1013 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 AL160408.2-201ENST00000436039 693 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 RIMS4-202ENST00000541604 1036 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 POLR3E-202ENST00000359210 2469 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 CCT6A-201ENST00000275603 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 ITGB4-201ENST00000200181 5919 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 PACS1-201ENST00000320580 4392 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 FAM208A-209ENST00000493960 5600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 PAAF1-205ENST00000535604 1695 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 NKAIN4-202ENST00000370313 1421 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 TMEM119-201ENST00000392806 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 KCNQ2-202ENST00000344462 2750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 CHAT-205ENST00000395562 2528 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 IGSF11-209ENST00000491903 1487 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 CTSB-228ENST00000533455 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 MCF2L-203ENST00000375604 6445 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 ZNF140-210ENST00000544426 2340 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 SPTBN4-212ENST00000598249 8070 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 PANK4-201ENST00000378466 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 AC140658.5-201ENST00000438532 169 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 OR10S1-201ENST00000531945 1121 ntAPPRIS P2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 RAMP2-205ENST00000589683 858 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 PRELID3A-208ENST00000590956 777 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 AC010615.2-202ENST00000597444 832 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 AL513210.1-201ENST00000629608 234 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 OR10S1-202ENST00000641123 1121 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 RNF216P1-203ENST00000404404 2427 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 SEPT9-237ENST00000591198 2160 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 NAP1L4-222ENST00000620138 2479 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 ETFA-203ENST00000557943 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 C7orf31-201ENST00000283905 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 PLA2G12A-201ENST00000243501 5226 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 IQCE-212ENST00000476665 2400 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 RAVER2-202ENST00000371072 4362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 LYPD5-202ENST00000414615 2137 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 NPM2-209ENST00000521157 1484 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 SLC22A12-205ENST00000473690 2522 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 NSFL1C-201ENST00000216879 3568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 BCAN-202ENST00000361588 2563 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 VSX2-201ENST00000261980 2995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 PROSER1-201ENST00000352251 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SIN3BO75182 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.7 ms