Protein–RNA interactions for Protein: O43900

PRICKLE3, Prickle planar cell polarity protein 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 615 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRICKLE3O43900 C17orf49-203ENST00000546760 764 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AP000275.2-202ENST00000553001 929 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AL138918.1-201ENST00000568306 659 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 SSH2-211ENST00000590153 570 ntTSL 4 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 WDR74-206ENST00000529106 1366 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 SHOX-201ENST00000334060 1951 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 LGALS3BP-218ENST00000591778 1961 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 PLCH2-203ENST00000378486 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 PLCH2-204ENST00000419816 4837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 PRPF31-203ENST00000419967 2269 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 SIRT6-203ENST00000594279 1507 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 SMAD3-201ENST00000327367 6247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 CPVL-202ENST00000396276 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 MFF-201ENST00000304593 2004 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 ZNF512B-201ENST00000369888 5919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 ELF3-201ENST00000359651 4994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 SNAPC3-202ENST00000380821 5680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 EFCAB14-201ENST00000371933 5767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 CHRNA5-201ENST00000299565 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 ARMC12-201ENST00000288065 1169 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 MRPL55-208ENST00000366734 990 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 MRPL55-217ENST00000366746 565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 MRPS18A-202ENST00000372133 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 LCN2-203ENST00000373017 848 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 TEX30-206ENST00000376032 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 VMO1-203ENST00000416307 712 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 DARS-AS1-203ENST00000438432 768 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AP000344.2-201ENST00000512987 629 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AC069503.2-201ENST00000546333 576 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AL133467.1-201ENST00000554161 993 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 METTL23-203ENST00000586738 1059 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 METTL23-205ENST00000588302 925 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AC090241.2-202ENST00000602333 633 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AC084121.4-201ENST00000641598 221 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AF228730.8-201ENST00000642140 221 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 B3GNT8-201ENST00000321702 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 SLC52A1-201ENST00000254853 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 DCAF12L2-201ENST00000360028 2599 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 REPIN1-203ENST00000444957 2969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 PBX2-201ENST00000375050 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 CDC25B-204ENST00000379598 2990 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 VPS37A-201ENST00000324849 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 EWSR1-206ENST00000397938 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 NINL-201ENST00000278886 4969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 GLOD4-202ENST00000301329 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 DUSP18-206ENST00000407308 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 OSBPL1A-203ENST00000399441 1887 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 MAP7-203ENST00000438100 2633 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 MYO1B-204ENST00000392318 5082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 DNAJB3-202ENST00000449667 1266 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 TIMM8BP1-201ENST00000452384 211 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AC026191.1-201ENST00000491930 829 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 SPINK2-203ENST00000506738 763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 CCND1-203ENST00000536559 553 ntTSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AC005330.1-201ENST00000590086 1238 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 RAB9A-203ENST00000618931 737 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.93■□□□□ 0.14
PRICKLE3O43900 CKMT1B-215ENST00000627381 1074 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
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