Protein–RNA interactions for Protein: O43583

DENR, Density-regulated protein, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 198 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DENRO43583 AC087481.3-201ENST00000602886 1894 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 SERPINE3-204ENST00000524365 2293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 GRAMD1C-201ENST00000358160 4177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 ZNF534-203ENST00000432303 956 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 AC092159.3-201ENST00000439196 571 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 UBE2K-204ENST00000503368 891 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 NEURL1B-202ENST00000520919 1089 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 AC117500.4-201ENST00000542797 617 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 ZNF534-205ENST00000617900 1085 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 ILKAP-212ENST00000622223 1088 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 AC010653.2-201ENST00000623505 997 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 HNRNPF-201ENST00000337970 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 AL135905.2-201ENST00000584934 1404 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 SRSF2-203ENST00000392485 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 C8orf49-201ENST00000525043 1968 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 CRAMP1-202ENST00000397412 7772 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 AL391807.1-203ENST00000604392 2365 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 ZCCHC4-201ENST00000302874 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 TTC22-202ENST00000371276 3345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 NORAD-201ENST00000565493 5339 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 ITGAV-202ENST00000374907 6903 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 ST8SIA5-202ENST00000536490 1499 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
DENRO43583 AP004608.1-203ENST00000528482 3679 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 ZNF514-201ENST00000295208 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 NR1H3-235ENST00000616973 1919 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 FEM1C-201ENST00000274457 5816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 DUSP22-202ENST00000419235 3098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 NUP62-212ENST00000597723 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 DGUOK-201ENST00000264093 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 DGUOK-202ENST00000348222 880 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 ATP5S-204ENST00000426751 1171 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 EHMT1-211ENST00000482340 691 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 CRIP2-202ENST00000483017 1176 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 CCNJL-205ENST00000519673 940 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 PPOX-214ENST00000535223 664 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 AC005606.2-201ENST00000564438 614 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 NEK4P2-201ENST00000580004 1012 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 TRAPPC5-203ENST00000595985 411 ntTSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 AC010522.1-205ENST00000598031 606 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 AC010531.6-201ENST00000602282 401 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 FAM197Y4-202ENST00000622692 608 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 DGUOK-208ENST00000629438 1029 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 SLC35A2-213ENST00000635015 1008 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 VPS72-207ENST00000640458 689 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 AC116562.4-202ENST00000641738 218 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 AC123912.2-201ENST00000594927 2409 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 IGF2-207ENST00000434045 1583 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 HARS2-206ENST00000508522 1562 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 MTFMT-201ENST00000220058 2734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 ARID4B-202ENST00000349213 5811 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 ARC-201ENST00000356613 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 GATA3-202ENST00000379328 3078 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 GPSM1-202ENST00000354753 3533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 PXN-207ENST00000536957 4112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 TRIM13-206ENST00000457662 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 CYP26A1-202ENST00000371531 2245 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 HYAL1-209ENST00000618175 2225 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 TSEN2-205ENST00000444864 2697 ntTSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 SERTAD4-201ENST00000367012 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
DENRO43583 CDH7-203ENST00000536984 3766 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 ZNF786-202ENST00000491431 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 LILRP2-201ENST00000413439 2127 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 TUBB3-206ENST00000554444 1978 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 CNOT6-207ENST00000618123 6250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 MFSD4B-201ENST00000368847 5958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 BCAR1-204ENST00000418647 3387 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
DENRO43583 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.2 ms