Protein–RNA interactions for Protein: O43567

RNF13, E3 ubiquitin-protein ligase RNF13, humanhuman

Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RNF13O43567 ZFAND6-211ENST00000559157 1559 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 NPY4R-202ENST00000612632 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 NPY4R2-202ENST00000613306 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 RUNDC3B-203ENST00000394654 2064 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 GMPPB-201ENST00000308375 3217 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 CTIF-201ENST00000256413 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 TEX19-201ENST00000333437 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 DNASE1L2-202ENST00000382437 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 ITGB1BP1-205ENST00000456913 1043 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 ITGB1BP1-216ENST00000488451 874 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 AP001107.6-201ENST00000526655 516 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 OR7E14P-202ENST00000530490 1290 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 GPHA2-202ENST00000532246 466 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 AL512357.1-201ENST00000557687 518 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 AL022328.2-201ENST00000608016 640 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 SBDS-205ENST00000617799 953 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 GRTP1-205ENST00000620217 1073 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 AC092902.2-205ENST00000622381 394 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 AC107918.4-202ENST00000641623 219 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 ANKHD1-EIF4EBP3-203ENST00000532219 8246 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 GBA2-202ENST00000378094 3757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 PTPRN2-201ENST00000389413 4723 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 WDR74-204ENST00000525239 1736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 INHA-201ENST00000243786 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
RNF13O43567 AC006504.4-201ENST00000592118 1568 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 MAPK8IP2-202ENST00000329492 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 MCF2L2-208ENST00000473233 4748 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 SLC9A3R1-202ENST00000413388 1285 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 ELK2BP-201ENST00000415014 1224 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 AC080013.1-203ENST00000468242 720 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 TXNRD2-212ENST00000485358 850 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 AC080013.1-201ENST00000495318 566 ntTSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 LMX1B-203ENST00000526117 1195 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 PAM16-208ENST00000573553 722 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 SMIM22-210ENST00000615471 928 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 AF228730.7-201ENST00000641842 219 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 AC064853.6-201ENST00000642029 303 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 CCNY-202ENST00000339497 4630 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 PCDH10-201ENST00000264360 8489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 SAMD4A-204ENST00000554335 3003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
RNF13O43567 NEUROD1-201ENST00000295108 2852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF13O43567 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF13O43567 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF13O43567 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF13O43567 ETV3L-201ENST00000454449 1976 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF13O43567 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF13O43567 KCNJ10-208ENST00000639408 1546 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF13O43567 FMNL3-202ENST00000352151 4006 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF13O43567 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF13O43567 MBD4-206ENST00000507208 2194 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF13O43567 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF13O43567 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF13O43567 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF13O43567 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF13O43567 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
RNF13O43567 LMNA-202ENST00000361308 1713 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.3 ms