Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

Predictions only

Length 2,377 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 MAT2A-202ENST00000409017 1927 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 RASA2-202ENST00000452898 2562 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 C19orf57-208ENST00000591586 1559 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 NRXN1-220ENST00000611589 1857 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 BCL2L12-203ENST00000441864 1371 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC026904.3-201ENST00000636550 1530 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 TIMM13-201ENST00000215570 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 IDUA-210ENST00000514224 2130 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 ERMARD-210ENST00000588451 2146 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 KIFC3-203ENST00000445690 3379 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 TOM1-201ENST00000382034 1300 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC004951.4-201ENST00000454572 2076 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 FBXL15-201ENST00000224862 2362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 CITED2-201ENST00000367651 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 ABCB10-201ENST00000344517 3857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 ISY1-201ENST00000273541 1704 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 PTGER3-201ENST00000306666 2333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 CCL25-203ENST00000390669 924 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC006033.1-201ENST00000440505 426 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC105233.2-201ENST00000523697 349 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 FXYD6-204ENST00000526014 2171 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AF228730.5-201ENST00000530288 346 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC010491.1-203ENST00000564167 638 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 PIMREG-202ENST00000570337 891 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 PIMREG-203ENST00000571373 1002 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 NDUFB1-207ENST00000617122 417 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 CNTNAP3-204ENST00000377656 4986 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 F11R-206ENST00000621309 4770 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 LHX8-201ENST00000294638 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 ARHGAP44-202ENST00000340825 4211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 SAP130-202ENST00000259235 4065 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 MFGE8-202ENST00000268151 1752 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 PRPF31-202ENST00000391755 1767 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 PGRMC1-202ENST00000535419 1762 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 CD2AP-201ENST00000359314 5412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 SEMA7A-203ENST00000543145 2304 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 MAPKAP1-205ENST00000373503 3045 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 TRAF2-201ENST00000247668 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 SEMA6C-209ENST00000613223 1950 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 SLC44A3-201ENST00000271227 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 MAP6-201ENST00000304771 3334 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 C1orf123-201ENST00000294360 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 C3orf22-201ENST00000318225 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 Z98752.1-201ENST00000442482 518 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 SPATA24-205ENST00000509959 641 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 TGIF1-218ENST00000551402 1089 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC013451.1-201ENST00000554552 518 ntTSL 4 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 MRPL34-203ENST00000595444 863 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 KRT79-201ENST00000330553 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 NRSN2-202ENST00000382291 2088 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 FBXO24-202ENST00000427939 2087 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 C9orf64-203ENST00000376344 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 PCDHB14-202ENST00000624896 2367 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 LINC00221-202ENST00000619530 1499 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 ZNF211-211ENST00000541801 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC138430.1-201ENST00000586064 5409 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 FAM219B-204ENST00000563119 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 HILPDA-201ENST00000257696 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 KIF1BP-204ENST00000626493 2337 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 RABL6-201ENST00000311502 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 ETNK2-202ENST00000367201 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 BHMT2-205ENST00000521567 1537 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 RUFY2-202ENST00000342616 983 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AL662890.1-201ENST00000396818 632 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AL358393.1-201ENST00000456771 532 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 ZNF890P-202ENST00000530367 1156 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC068152.1-201ENST00000575930 685 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC073389.1-201ENST00000595595 795 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AL031055.1-201ENST00000606362 631 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 AC018529.1-201ENST00000613063 361 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 ESR2-206ENST00000553796 1634 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 SEMA3B-209ENST00000456560 2221 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 SYBU-224ENST00000529690 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 BTBD11-201ENST00000280758 5767 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 ENTPD6-209ENST00000433259 2654 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 RMND1-205ENST00000622845 1484 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 SNX9-201ENST00000392185 4198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 ARHGAP28-203ENST00000383472 2295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
CACNA1GO43497 SHKBP1-201ENST00000291842 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 67.4 ms