Protein–RNA interactions for Protein: O14529

CUX2, Homeobox protein cut-like 2, humanhuman

Predictions only

Length 1,486 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUX2O14529 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUX2O14529 LIN54-209ENST00000510557 2257 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUX2O14529 PROC-201ENST00000234071 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUX2O14529 CDK11A-205ENST00000378633 2458 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUX2O14529 CORO1C-204ENST00000541050 2487 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUX2O14529 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUX2O14529 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUX2O14529 SERF2-206ENST00000409291 807 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUX2O14529 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUX2O14529 AL627389.1-201ENST00000413508 1182 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CUX2O14529 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUX2O14529 EIF3K-202ENST00000538434 966 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUX2O14529 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUX2O14529 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUX2O14529 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC27.95■■■□□ 2.06
CUX2O14529 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUX2O14529 NMNAT3-203ENST00000413939 1711 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUX2O14529 SIL1-213ENST00000509534 1714 ntTSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUX2O14529 GNS-208ENST00000543646 2164 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUX2O14529 PCSK5-202ENST00000376767 2845 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.06
CUX2O14529 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CUX2O14529 AC133963.1-201ENST00000504166 1679 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CUX2O14529 TMEM235-202ENST00000421688 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CUX2O14529 C17orf62-202ENST00000342572 1849 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CUX2O14529 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CUX2O14529 BORCS6-201ENST00000389017 2575 ntAPPRIS P1 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CUX2O14529 AC008764.1-201ENST00000409035 2567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CUX2O14529 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CUX2O14529 RPP40-201ENST00000319533 1088 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CUX2O14529 GAD1-203ENST00000375272 1252 ntTSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CUX2O14529 AC025165.3-201ENST00000471530 679 ntTSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CUX2O14529 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CUX2O14529 HTT-AS1_1.1-201ENST00000612914 230 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CUX2O14529 AC005702.4-201ENST00000618393 416 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
CUX2O14529 SPATA20-226ENST00000619622 2769 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.94■■■□□ 2.06
CUX2O14529 SNAP47-201ENST00000315781 2367 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
CUX2O14529 AC119396.1-201ENST00000576789 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUX2O14529 SERF2-203ENST00000381359 1931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUX2O14529 PPM1B-201ENST00000282412 2606 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUX2O14529 T-201ENST00000296946 2436 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUX2O14529 AMT-232ENST00000636199 1546 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUX2O14529 SOST-201ENST00000301691 2300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUX2O14529 SLC22A17-204ENST00000397267 2455 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUX2O14529 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUX2O14529 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUX2O14529 PDE6B-202ENST00000429163 2120 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUX2O14529 MYO16-AS1-201ENST00000439299 580 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUX2O14529 AL109811.2-201ENST00000447600 487 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUX2O14529 RN7SL818P-201ENST00000485099 259 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CUX2O14529 SNAI3-AS1-206ENST00000569786 588 ntTSL 3 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUX2O14529 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CUX2O14529 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CUX2O14529 RN7SL725P-201ENST00000606439 259 ntBASIC27.93■■■□□ 2.06
CUX2O14529 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUX2O14529 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUX2O14529 ALDH3A1-206ENST00000457500 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUX2O14529 TINF2-201ENST00000267415 1852 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUX2O14529 CEP78-201ENST00000277082 2542 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUX2O14529 EIF3B-202ENST00000397011 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUX2O14529 MBD1-207ENST00000398488 1512 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUX2O14529 GFER-201ENST00000248114 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
CUX2O14529 CAPN1-226ENST00000533820 3083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUX2O14529 MSLNL-201ENST00000442466 2109 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUX2O14529 NBL1-212ENST00000621723 2133 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUX2O14529 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUX2O14529 LRRD1-201ENST00000343318 2073 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUX2O14529 PTPA-204ENST00000355007 2515 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUX2O14529 SYN2-206ENST00000621198 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUX2O14529 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUX2O14529 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUX2O14529 C9orf24-203ENST00000379126 496 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUX2O14529 AC243961.1-201ENST00000432559 384 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUX2O14529 AC245056.1-201ENST00000437631 384 ntTSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUX2O14529 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CUX2O14529 AC106760.1-201ENST00000508690 800 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CUX2O14529 TMEM33-208ENST00000513702 1092 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUX2O14529 AC245884.6-201ENST00000515672 1067 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CUX2O14529 MIR22HG-212ENST00000577164 931 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUX2O14529 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUX2O14529 SLC47A2-201ENST00000325411 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUX2O14529 BICD1-207ENST00000551848 1962 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
CUX2O14529 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUX2O14529 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUX2O14529 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
CUX2O14529 CTSB-204ENST00000453527 2011 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CUX2O14529 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CUX2O14529 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CUX2O14529 MVB12A-201ENST00000317040 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CUX2O14529 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CUX2O14529 RPL13AP19-201ENST00000434320 584 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CUX2O14529 SELENOT-203ENST00000477889 944 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CUX2O14529 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CUX2O14529 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CUX2O14529 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC27.91■■■□□ 2.06
CUX2O14529 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CUX2O14529 ILVBL-209ENST00000534378 2067 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
CUX2O14529 FAM160A2-201ENST00000265978 3481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CUX2O14529 KRT6C-201ENST00000252250 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CUX2O14529 KRT6B-201ENST00000252252 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
CUX2O14529 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms