Protein–RNA interactions for Protein: O00716

E2F3, Transcription factor E2F3, humanhuman

Predictions only

Length 465 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F3O00716 TCTN1-208ENST00000471804 718 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F3O00716 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F3O00716 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F3O00716 SPCS2-207ENST00000530257 612 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F3O00716 CD63-204ENST00000546939 779 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F3O00716 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F3O00716 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F3O00716 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F3O00716 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F3O00716 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F3O00716 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F3O00716 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F3O00716 MAP3K9-201ENST00000381250 4025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F3O00716 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F3O00716 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F3O00716 TXNDC11-201ENST00000283033 3140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F3O00716 BTN3A1-204ENST00000425234 1882 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F3O00716 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F3O00716 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F3O00716 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F3O00716 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F3O00716 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F3O00716 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F3O00716 ABTB1-201ENST00000232744 1965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F3O00716 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F3O00716 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F3O00716 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC16.26■□□□□ 0.19
E2F3O00716 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 TRAPPC11-201ENST00000334690 4552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 AC006019.1-201ENST00000425591 2470 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 ABHD15-201ENST00000307201 3592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 HOXA5-201ENST00000222726 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 SPCS1-201ENST00000233025 1082 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 MAGIX-204ENST00000614074 778 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 CAND2-206ENST00000626378 333 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 ACY1-212ENST00000635797 1294 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 ADORA1-209ENST00000640524 653 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 TLCD2-201ENST00000330676 5971 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 NKIRAS1-202ENST00000412028 1605 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 CARNS1-201ENST00000307823 3942 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 LMCD1-204ENST00000426878 1431 ntTSL 2 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 FMO5-208ENST00000578284 1784 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 NR2C2-201ENST00000323373 2406 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 WDR45-206ENST00000376368 1381 ntTSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.25■□□□□ 0.19
E2F3O00716 SIN3A-203ENST00000394949 4930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 SLC6A9-204ENST00000372307 2162 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 CAMK2D-201ENST00000296402 5820 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 KIF25-201ENST00000351261 1326 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 FOXP3-201ENST00000376197 1326 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 RNF19A-201ENST00000341084 4285 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 REEP4-202ENST00000334530 1476 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 LCK-202ENST00000336890 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 PLA2G16-203ENST00000415826 1099 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 FAM71E1-202ENST00000595790 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 AL356488.2-201ENST00000602755 427 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 PLA2G16-206ENST00000639271 957 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
E2F3O00716 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 60.8 ms