Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 LMBR1L-204ENST00000547382 2235 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 LYPLAL1-202ENST00000366928 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 GYPC-202ENST00000356887 2067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 DMRTA2-201ENST00000404795 3137 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 DENND6B-201ENST00000413817 4939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 THEM4-201ENST00000368814 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 GIT1-203ENST00000394869 3711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 KLHL22-201ENST00000328879 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 CROCC2-201ENST00000443866 5382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 NAGK-205ENST00000443938 1221 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP3K6-201ENST00000357582 4136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 TCP1-203ENST00000420894 1671 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 PCBP3-204ENST00000400309 1986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 DNAJB2-201ENST00000336576 3176 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 SUZ12-201ENST00000322652 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 TTBK2-208ENST00000622375 6891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
NEDD8-MDP1E9PL57 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 MAP3K9-206ENST00000555993 4449 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 SYNPO-201ENST00000307662 5374 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 CPZ-203ENST00000382480 2538 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 TSC22D3-213ENST00000506081 956 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 NAA60-208ENST00000570819 833 ntTSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AL158211.3-201ENST00000607385 239 ntBASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPN20-203ENST00000374342 1929 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 ABCC5-203ENST00000382494 1923 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 TBX4-201ENST00000240335 2470 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 CSF1-204ENST00000369802 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 CRMP1-202ENST00000397890 2911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 DNM1-216ENST00000634267 2909 ntTSL 5 BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF84-201ENST00000327668 7162 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 INPP4A-205ENST00000409851 3365 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 ACOT12-201ENST00000307624 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 PIGX-202ENST00000392391 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 KRCC1-201ENST00000347055 1753 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 WASF1-205ENST00000392587 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 CEBPG-201ENST00000284000 4109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 DAPK1-202ENST00000408954 5892 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 P2RY6-202ENST00000393590 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 IGF2-204ENST00000381406 5179 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 CDK2-204ENST00000553376 1725 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 ZSWIM8-223ENST00000605216 6004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 CIB3-201ENST00000269878 711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AC124057.1-201ENST00000433035 404 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AC018653.3-201ENST00000544657 749 ntTSL 3 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AC010735.2-201ENST00000607970 584 ntTSL 4 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 GTF2IRD2-205ENST00000614386 578 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 ZNF419-201ENST00000221735 2309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
NEDD8-MDP1E9PL57 GALNT17-201ENST00000333538 3884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.9 ms