Protein–RNA interactions for Protein: B7ZW38

HNRNPCL3, Heterogeneous nuclear ribonucleoprotein C-like 3, humanhuman

Predictions only

Length 293 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HNRNPCL3B7ZW38 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 AL596257.1-201ENST00000641463 2694 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 MRPS18A-201ENST00000372116 785 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 POMC-203ENST00000395826 959 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 NPY-203ENST00000407573 705 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 AC109309.1-201ENST00000418995 435 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 ETFA-208ENST00000559602 792 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 IFNL4P1-201ENST00000607083 540 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 AC244517.11-201ENST00000624192 573 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 GPN3-202ENST00000537466 1491 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 ZNF496-201ENST00000294753 5336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 GPER1-206ENST00000617001 1900 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 MPIG6B-204ENST00000375809 2396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 SCP2-213ENST00000528311 1896 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 CNGA3-205ENST00000436404 2504 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 LBX1-201ENST00000370193 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 AC005052.1-201ENST00000625181 2492 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 CHN1-205ENST00000409900 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 KIAA1217-206ENST00000376462 6123 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 CAPRIN1-207ENST00000529307 2266 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 PACS1-209ENST00000529757 1688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 UGCG-201ENST00000374279 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 DHDH-201ENST00000221403 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 KCNG3-201ENST00000306078 3824 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 KCNAB2-205ENST00000378092 1202 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 TSTD1-204ENST00000423014 593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 C1orf226-202ENST00000426197 1049 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 RPS2P1-201ENST00000434010 821 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 CLEC4GP1-201ENST00000596555 870 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 AC008667.4-201ENST00000607370 168 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 SMN2-213ENST00000614240 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 MIR1199-201ENST00000621445 119 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 ARHGEF16-202ENST00000378373 2211 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 CIAPIN1-209ENST00000567518 2016 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 KCTD11-201ENST00000333751 2783 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 COG5-203ENST00000393603 5418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 PUS1-208ENST00000542167 2151 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 SUSD4-202ENST00000343846 3480 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 CTCF-201ENST00000264010 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 AC063926.3-201ENST00000624734 5658 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 NCAPH2-205ENST00000420993 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 GLOD4-203ENST00000536578 2497 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 MRNIP-201ENST00000292586 1238 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 DPM3-201ENST00000341298 486 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 TRIM36-203ENST00000379618 693 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 RNPS1P1-201ENST00000507437 918 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
HNRNPCL3B7ZW38 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.4 ms