Protein–RNA interactions for Protein: B2RUZ4

SMIM1, Small integral membrane protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 78 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMIM1B2RUZ4 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 RBFADN-201ENST00000562391 1350 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 RBM47-202ENST00000381793 4816 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 LINC00884-202ENST00000448892 2680 ntTSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 C20orf196-201ENST00000303142 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 HES7-201ENST00000317814 678 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 RNF152P1-201ENST00000397754 604 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 RARRES1-204ENST00000479756 839 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AC013356.2-201ENST00000559730 729 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 CLN6-204ENST00000564752 900 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 ANAPC11-204ENST00000571024 668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 ANAPC11-218ENST00000582222 523 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 CLN6-214ENST00000636314 442 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 SCRN2-202ENST00000407215 1779 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 SPATA21-205ENST00000540400 1773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 SNX33P1-201ENST00000592116 1762 ntBASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 TMC6-216ENST00000590602 5268 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 MBD1-202ENST00000269471 2980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 PLVAP-201ENST00000252590 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 PLEKHA8-205ENST00000449726 7835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 ARL5B-201ENST00000377275 7196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 SKP2-201ENST00000274254 1537 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 PEX13-204ENST00000444100 1533 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 PARVB-210ENST00000619710 1530 ntTSL 1 (best) BASIC11.3□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 NR4A3-202ENST00000338488 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AC243591.1-201ENST00000452967 1364 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 TSNARE1-205ENST00000520166 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AL512652.2-201ENST00000625156 1716 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 ILF3-210ENST00000588657 2697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 C19orf68-203ENST00000614654 3588 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 NIM1K-201ENST00000326035 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AC007182.1-201ENST00000455232 2159 ntTSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 PDXDC1-204ENST00000455313 2183 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 UBL5-201ENST00000358666 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 RHOC-204ENST00000369633 1295 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 TNFRSF10C-202ENST00000397703 1242 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AC113347.1-201ENST00000413321 391 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AC087499.1-201ENST00000418141 1075 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AL096828.1-201ENST00000423020 542 ntTSL 4 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AL137013.1-201ENST00000432946 1228 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 CDKN2AIPNL-202ENST00000458198 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 RNASEH2C-202ENST00000527610 835 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 YPEL3-207ENST00000566134 761 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 LINC00092-202ENST00000580908 580 ntTSL 2 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AC020558.2-201ENST00000582325 795 ntTSL 3 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AXIN2-208ENST00000611991 1019 ntTSL 5 BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AC083849.1-201ENST00000615227 514 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 ABBA01031661.1-201ENST00000634362 1253 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
SMIM1B2RUZ4 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC11.29□□□□□ -0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 74.1 ms