Protein–RNA interactions for Protein: A7XYQ1

SOBP, Sine oculis-binding protein homolog, humanhuman

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Length 873 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SOBPA7XYQ1 IMPAD1-201ENST00000262644 7199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 PCDHA8-201ENST00000378123 2616 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 OLIG2-201ENST00000333337 3262 ntAPPRIS P1 BASIC17.15■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 FAM9B-202ENST00000362066 2047 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 ZDHHC9-202ENST00000371064 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 C6orf106-202ENST00000374023 4418 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.34
SOBPA7XYQ1 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 SKOR1-204ENST00000554240 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AL023806.1-201ENST00000603994 1649 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 ZNF623-201ENST00000458270 2733 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 U73166.1-201ENST00000439898 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 TBC1D2-205ENST00000465784 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 CHIA-203ENST00000353665 1214 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AC027369.6-201ENST00000525520 931 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 LITAF-210ENST00000571976 548 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 LITAF-214ENST00000574703 486 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AC092070.4-201ENST00000599803 507 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 YTHDF3-AS1-201ENST00000603538 718 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 CARD10-202ENST00000403299 4113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 COL5A3-201ENST00000264828 6174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 HIST1H2AC-202ENST00000377791 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 MDM2-209ENST00000393412 1404 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AC100757.3-201ENST00000622361 1406 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 HGNC:18790-211ENST00000621129 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 ZNF57-201ENST00000306908 2003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 ZNF57-205ENST00000614108 2002 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 ASCC2-223ENST00000542393 2594 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 PFKFB3-215ENST00000536985 2094 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 CLEC18B-206ENST00000620745 1847 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 POLR1C-201ENST00000304004 1280 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 CTHRC1-201ENST00000330295 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 LCE1E-201ENST00000368770 1180 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 TSSK5P-201ENST00000423978 907 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AC082651.1-201ENST00000478468 832 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AC008761.3-201ENST00000624803 892 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 NLE1-203ENST00000586869 5286 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 PDE1C-206ENST00000396193 5109 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 FAHD2B-202ENST00000414820 1388 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 ATAD3A-207ENST00000536055 2332 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 PC-204ENST00000524491 1714 ntTSL 2 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 ADGRA3-202ENST00000334304 4566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 CLSTN1-202ENST00000377298 5221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AP001189.5-201ENST00000637683 1413 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 GDA-201ENST00000238018 2074 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AC118553.2-202ENST00000638792 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 HR-201ENST00000312841 5351 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 CEP19-202ENST00000409690 2201 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 RNF157-201ENST00000269391 4955 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 ADIRF-AS1-201ENST00000418273 2627 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 WLS-205ENST00000370976 2332 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AL512625.3-203ENST00000445604 1602 ntTSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 PAGE5-201ENST00000289619 741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 ASMT-201ENST00000381229 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 METTL26-204ENST00000397665 558 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AC078942.1-201ENST00000448698 589 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 LINC01160-202ENST00000450155 894 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 SATB1-217ENST00000493952 626 ntTSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 NDUFAB1-205ENST00000570319 885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 AC087645.2-202ENST00000586583 643 ntTSL 4 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 LINC02560-201ENST00000596379 459 ntBASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 HIST1H3D-202ENST00000635200 948 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 TPD52L1-213ENST00000534000 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
SOBPA7XYQ1 CYP2U1-202ENST00000508453 3125 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
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