Protein–RNA interactions for Protein: A6NF36

CCDC182, Coiled-coil domain-containing protein 182, humanhuman

Predictions only

Length 153 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC182A6NF36 CYP2D6-203ENST00000360608 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC182A6NF36 AC126755.2-202ENST00000427999 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
CCDC182A6NF36 ZNF180-202ENST00000391956 3049 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 RAB3IP-207ENST00000483530 1755 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 CHID1-203ENST00000436108 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 TP73-AS1-210ENST00000637775 1455 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 PYCR1-201ENST00000329875 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 AC073324.2-201ENST00000626532 2941 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 KCNK7-203ENST00000394216 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 ZP3-204ENST00000416245 1846 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 CD1E-213ENST00000444681 1820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 SLC39A8-202ENST00000394833 3238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 ELOF1-203ENST00000586683 2154 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 OXT-201ENST00000217386 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 CARHSP1-201ENST00000311052 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 C18orf32-201ENST00000318240 1128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 PSMB8-202ENST00000374882 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 DDRGK1-202ENST00000380201 1128 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 HDAC11-204ENST00000404040 967 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 ACTG1P4-201ENST00000425123 1122 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 PCAT7-201ENST00000452148 1164 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 ABR-204ENST00000543210 1049 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 AC015712.1-203ENST00000559331 593 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 ABR-217ENST00000572441 563 ntTSL 4 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 KCNE1B-204ENST00000623803 811 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 JRK-203ENST00000571961 2687 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 IL12RB2-206ENST00000544434 3782 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 IRX6-201ENST00000290552 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 ELF2-207ENST00000510408 1965 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 ZNF804B-201ENST00000333190 4659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 STARD4-203ENST00000502322 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 PMPCAP1-201ENST00000508114 1576 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 TMEM127-201ENST00000258439 6266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 NACC2-201ENST00000277554 6899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 AL139300.1-201ENST00000472726 2505 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 CCDC120-203ENST00000536628 2381 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 C11orf68-203ENST00000530188 1528 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 TMUB2-213ENST00000589856 1505 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 OSBPL9-222ENST00000531828 2210 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 BAG5-202ENST00000337322 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 RGN-202ENST00000352078 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 WWTR1-204ENST00000467467 1603 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 PAX3-201ENST00000258387 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 BCL2L10-201ENST00000260442 1249 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 PSMA7-201ENST00000370858 925 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 PSMA7-203ENST00000370873 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 MPIG6B-202ENST00000375805 668 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 LINC01128-207ENST00000449005 874 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 VENTXP7-201ENST00000475503 772 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 DUX4L26-201ENST00000489078 1255 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 ZNF706-204ENST00000518336 501 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 LTBR-211ENST00000543190 785 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 CRNDE-210ENST00000560912 459 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 NTF6B-201ENST00000591913 560 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 NECAP2-201ENST00000337132 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 AC097376.2-201ENST00000608661 2510 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 SLC9A7P1-201ENST00000554295 3311 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 FOXP3-202ENST00000376199 2274 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 DCAF11-217ENST00000559115 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
CCDC182A6NF36 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.7 ms