Protein–RNA interactions for Protein: A2VCL2

CCDC162P, Coiled-coil domain-containing protein 162, humanhuman

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC162PA2VCL2 AC092364.2-201ENST00000596710 2692 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 INPP5J-204ENST00000402238 1564 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 IKBKE-204ENST00000584998 2487 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 SIGLEC7-201ENST00000305628 1469 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 AFF2-204ENST00000370458 1488 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 SYT6-205ENST00000609117 4424 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 TLL1-204ENST00000507499 4818 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 AIFM1-201ENST00000287295 2260 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 ADGRB2-206ENST00000398556 4879 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 ZNF213-206ENST00000574902 3208 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 PCM1-206ENST00000518537 2171 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 CCDC183-201ENST00000338005 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 ART5-201ENST00000359918 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 ADIPOR1-202ENST00000367254 1116 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 FNDC11-202ENST00000370098 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 TMEM128-202ENST00000382753 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 AL391069.2-202ENST00000447795 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 AC084125.4-201ENST00000580385 338 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 NUTM2B-AS1-211ENST00000601369 1233 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 SELENOM-210ENST00000611680 689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 CCL3-204ENST00000613922 778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 AC010507.1-201ENST00000633895 436 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 COQ7-201ENST00000321998 2657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 LRRN4-201ENST00000378858 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 SLC1A6-208ENST00000598504 2987 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 FAM227A-201ENST00000355830 2417 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 WDR45B-201ENST00000392325 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 SPATC1-201ENST00000377470 2007 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 SLC9A3P2-201ENST00000447821 2021 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 FUT3-202ENST00000458379 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 SATB2-202ENST00000417098 5730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 MGEA5-202ENST00000361464 5155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 AC006449.5-201ENST00000610658 2098 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 ACP5-203ENST00000433365 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 TBC1D10C-203ENST00000526387 1520 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 ICOSLG-201ENST00000344330 1009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 MYL6-202ENST00000348108 722 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 SLC2A8-201ENST00000373352 914 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 RALGDS-205ENST00000393160 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 HMGA1P7-201ENST00000406908 502 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 AC026396.1-201ENST00000419388 421 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 AL590627.1-203ENST00000421194 1026 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 AC007834.1-201ENST00000446473 728 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 ATP6V1C2-204ENST00000635370 1578 ntTSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 KANK1-204ENST00000382293 5249 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 DUSP8-202ENST00000397374 4480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 RECQL4-210ENST00000621189 3896 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 RBM4-204ENST00000408993 1763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 DHRS1-201ENST00000288111 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 IGLL5-203ENST00000532223 1335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 SULT1A2-204ENST00000533150 1991 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 TGIF1-205ENST00000401449 1670 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 NKIRAS1-208ENST00000443659 2391 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 AC026412.1-202ENST00000512335 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 TRIM11-201ENST00000284551 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 PBX1-219ENST00000560641 3225 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 MIDN-201ENST00000300952 3790 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
CCDC162PA2VCL2 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 29.8 ms