Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y5W8

SNX13, Sorting nexin-13, humanhuman

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Length 968 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SNX13Q9Y5W8 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SNX13Q9Y5W8 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 UBE2J2-204ENST00000400929 1057 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 AC114763.1-202ENST00000414911 867 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SNX13Q9Y5W8 LY6E-213ENST00000522528 606 ntTSL 3 BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SNX13Q9Y5W8 MED9-202ENST00000580462 565 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
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SNX13Q9Y5W8 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 KIAA1211-201ENST00000264229 4109 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 AC011840.1-202ENST00000436477 1351 ntTSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 PTPRU-201ENST00000345512 4470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 ELL-203ENST00000596124 1852 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 KCNG3-202ENST00000394973 3656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 AL603832.2-201ENST00000566195 2125 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SNX13Q9Y5W8 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SNX13Q9Y5W8 AHCY-201ENST00000217426 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 GGCT-202ENST00000275428 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 PYDC1-201ENST00000302964 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 CXorf40A-202ENST00000393985 1148 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 PRICKLE4-202ENST00000394260 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 PRICKLE4-203ENST00000394263 1155 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SNX13Q9Y5W8 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
SNX13Q9Y5W8 SLITRK2-202ENST00000370490 7672 ntAPPRIS P1 BASIC15.96■□□□□ 0.15
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SNX13Q9Y5W8 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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SNX13Q9Y5W8 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
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SNX13Q9Y5W8 ELMSAN1-202ENST00000394071 7721 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 HCFC1-201ENST00000310441 8869 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 DUOXA2-201ENST00000323030 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 MCRS1-202ENST00000357123 1428 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 LMAN1-201ENST00000251047 5521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 NBEAL2-205ENST00000450053 8827 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 CMTM2-202ENST00000379486 904 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 RPL8-202ENST00000394920 965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 GGT1-205ENST00000403838 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 ELF3-AS1-202ENST00000419190 788 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 ACY1-210ENST00000494103 1298 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 CCNG1-211ENST00000512163 919 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 TUBA1A-203ENST00000546918 984 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 AC008687.7-201ENST00000593309 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 AC124864.1-201ENST00000623408 392 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
SNX13Q9Y5W8 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
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